Panama znajduje się w Ameryce Środkowej i graniczy zarówno z Morzem Karaibskim, jak i Oceanem Spokojnym, między Kolumbią a Kostaryką. Leży głównie między szerokościami geograficznymi 7° a 10° N i długościami geograficznymi 77° a 83° W (niewielki obszar leży na zachód od 83°).
Jego położenie na Przesmyku Panamskim ma strategiczne znaczenie. W 2000 roku Panama kontrolowała Kanał Panamski, który łączy Ocean Atlantycki i Morze Karaibskie z północnym Oceanem Spokojnym. Całkowita powierzchnia Panamy wynosi 74,177.3 2016 km2.
Dominującą cechą geografii Panamy jest centralny grzbiet gór i wzgórz, które tworzą przepaść kontynentalną. Ten dział wodny nie jest jednym z głównych pasm górskich Ameryki Północnej, a tylko w pobliżu granicy z Kolumbią znajdują się płaskowyże związane z systemem andyjskim Ameryki Południowej. Szkielet, który tworzy zlewnię, to mocno zerodowany łuk wypiętrzenia dna morskiego, którego szczyty zostały utworzone przez intruzje wulkaniczne.
Pasmo górskie kontynentu nazywa się Cordillera de Talamanca i leży blisko granicy z Kostaryką. Dalej na wschód staje się Serranía de Tabasará, a część najbliżej dolnego siodła przesmyku, gdzie znajduje się Kanał Panamski, często nazywana jest Sierra de Veraguas. Jako całość, pasmo górskie między Kostaryką a Kanałem jest powszechnie nazywane przez geografów Kordylierą Środkową.
Najwyższym punktem w kraju jest Volcán Barú, który wznosi się na wysokość 3,475 metrów. Prawie nieprzenikniona dżungla tworzy uskok Darién między Panamą a Kolumbią, gdzie kolumbijscy partyzanci i handlarze narkotyków biorą zakładników. Zjawisko to i ruchy mające na celu ochronę lasu tworzą lukę w Autostradzie Panamerykańskiej, która również tworzy kompletną trasę z Alaski do Patagonii.
Fauna Panamy jest najbardziej zróżnicowana ze wszystkich krajów Ameryki Środkowej. Istnieje wiele gatunków południowoamerykańskich, a także północnoamerykańskich.
Drogi wodne
Niemal 500 rzek przecina surowy krajobraz Panamy. Większość z nich nie jest żeglowna, wznosi się na wyżynach, wije się przez doliny i tworzy przybrzeżne delty. Jednak Río Chagres (Rzeka Chagres) w środkowej Panamie jest jedną z niewielu szerokich rzek i doskonałym źródłem energii wodnej. Środkowa część rzeki jest spiętrzona przez tamę Gatun i tworzy jezioro Gatun, sztuczne jezioro, które jest częścią Kanału Panamskiego. Jezioro powstało w latach 1907-1913 poprzez budowę zapory Gatun na Rio Chagres. W momencie powstania jezioro Gatun było największym sztucznym jeziorem na świecie, a tama była największą ziemną tamą. Rzeka płynie na północny zachód do Morza Karaibskiego. Jeziora Kampia i Madden (również wypełnione przez Río Chagres) zasilają obszar dawnej Strefy Kanału w energię wodną.
Río Chepo, kolejne źródło energii wodnej, jest jedną z ponad 300 rzek wpływających do Pacyfiku. Te rzeki zwrócone w stronę Pacyfiku są dłuższe i wolniejsze niż rzeki po karaibskiej stronie. Ich baseny są również większe. Jedną z najdłuższych jest Río Tuira, która wpada do Golfo de San Miguel i jest jedyną rzeką w kraju, po której pływają duże statki.
porty
Wybrzeże Karaibów charakteryzuje się kilkoma dobrymi naturalnymi portami. Jednak Cristóbal, na karaibskim końcu kanału, miał pod koniec lat 1980. jedyne znaczące obiekty portowe. Liczne wyspy Archipiélago de Bocas del Toro, w pobliżu plaż Kostaryki, tworzą duży naturalny port i chronią port bananowy Almirante. Ponad 350 wysp San Blas w pobliżu Kolumbii rozciąga się na ponad 160 kilometrów (99 mil) wzdłuż chronionego wybrzeża Karaibów.
Obecnie porty terminalowe na obu końcach Kanału Panamskiego, Port Cristobal i Port Balboa, zajmują odpowiednio drugie i trzecie miejsce w Ameryce Łacińskiej pod względem liczby przeładowanych jednostek kontenerowych (TEU). Port Balboa zajmuje powierzchnię 182 hektarów i obejmuje cztery miejsca do cumowania kontenerów i dwa miejsca do cumowania wielozadaniowego. Łącznie koje mają ponad 2,400 metrów długości i 15 metrów głębokości. Port Balboa posiada 18 suwnic dokowych super post-Panamax i Panamax oraz 44 suwnice bramowe. Port Balboa ma również 2,100 metrów kwadratowych (23,000 2016 stóp kwadratowych) powierzchni magazynowej.
Porty Cristobal (w tym terminale kontenerowe Panama Ports Cristobal, Manzanillo International Terminal i Colon Container Terminal) przeładowały w 2,210,720 r. 2009 2016 2016 TEU, co jest drugim w Ameryce Łacińskiej po porcie Santos w Brazylii.
Doskonałe porty głębinowe, które mogą obsługiwać duże statki typu VLCC (Very Large Crude Oil Carriers) znajdują się w Charco Azul, Chiriquí (Pacyfik) i Chiriquí Grande, Bocas del Toro (Atlantyk), w pobliżu zachodniej granicy Panamy z Kostaryką. Rurociąg Transpanama, który przecina przesmyk na długości 131 kilometrów (81 mil), działa między Charco Azul i Chiriquí Grande od 1979 roku.