Z powodu niestabilności politycznej i braków w kontaktach z jej koloniami, zwłaszcza Indochinami i Algierią, Czwarta Republika Francuska upadła w 1958 r. Francuzi poparli utworzenie V Republiki, a prezydent Francji Charles de Gaulle wyjaśnił to 8 sierpnia 1958 r. , że francuskie kolonie będą musiały wybrać między większą autonomią w nowej Wspólnocie Francuskiej a natychmiastową niepodległością w głosowaniu 28 września 1958. Inne kolonie wybrały tę pierwszą, ale Gwinea zdecydowanie głosowała za niepodległością, kierowany przez Ahmeda Sékou Touré, którego Demokratyczny Partia Gwinei (PDG) zdobyła 56 z 60 mandatów w wyborach terytorialnych w 1957 roku. Francuzi wkrótce odeszli, a Gwinea ogłosiła się suwerenną i niezależną republiką 2 października 1958 roku, z Sékou Touré jako prezydentem.
Gwinea szybko sprzymierzyła się ze Związkiem Radzieckim po odejściu Francji i przyjęła politykę komunistyczną. Z drugiej strony Gwinea skłaniała się ku chińskiej formie socjalizmu, a partnerstwo było krótkotrwałe. Mimo to narody kapitalistyczne, takie jak Stany Zjednoczone, nadal dostarczały krajowi pomocy i inwestycji. Poprawiły się nawet stosunki z Francją; handel wzrósł po wyborze Valéry'ego Giscarda d'Estaing na prezydenta Francji, a oba kraje wymieniły oficjalne wizyty.
Touré ogłosił, że PDG jest jedyną legalną partią w 1960 roku. Rząd i PDG połączyły się na następne 24 lata. Touré był bezsporny przez cztery siedmioletnie kadencje jako prezydent, a wyborcy co pięć lat otrzymywali jedną listę kandydatów PDG do Zgromadzenia Narodowego. Touré wkrótce stał się polaryzującym przywódcą, opowiadając się za hybrydą afrykańskiego socjalizmu w kraju i panafrykanizmem za granicą, a jego administracja stała się nietolerancyjna wobec krytyki, więziąc setki i dusząc prasę.
W tym okresie rząd Gwinei znacjonalizował terytorium, usunął tradycyjnych przywódców mianowanych przez Francuzów oraz zerwał stosunki z rządem francuskim i przedsiębiorstwami. Sytuacja gospodarcza Gwinei stała się tak niepewna, jak jej postawa dyplomatyczna, oscylująca między poparciem dla Związku Radzieckiego a (pod koniec lat 1970.) poparciem dla Stanów Zjednoczonych. Rząd Touré zaatakował rzeczywistych i wyimaginowanych przeciwników, zmuszając tysiące przeciwników politycznych do emigracji, zarzucając mu plany i spiski przeciwko niemu w kraju i za granicą.
W 1970 r. emigracyjne oddziały opozycyjne z Gwinei pomogły portugalskim żołnierzom z sąsiedniej Gwinei Portugalskiej w operacji Morze Zielone, wtargnięciu do Gwinei. Portugalskie wojsko próbowało zamordować lub aresztować Sekou Toure'a między innymi za wsparcie PAIGC, grupy partyzanckiej działającej w Gwinei Portugalskiej. Wojska portugalskie wycofały się po zrealizowaniu większości swoich celów po wielu dniach intensywnej walki. Częstotliwość wewnętrznych aresztowań i egzekucji wzrosła za panowania Sékou Touré.
Pomnik upamiętniający triumf wojskowy przeciwko portugalskiemu atakowi w 1970 roku. Jedynym celem, którego nie udało się osiągnąć portugalskiemu atakowi, było schwytanie Ahmeda Sékou Touré.
Sékou Touré zmarł 26 marca 1984 roku w Stanach Zjednoczonych po operacji serca, a jego następcą został premier Louis Lansana Beavogui, który miał pełnić funkcję tymczasowego prezydenta do czasu nowych wyborów.
3 kwietnia 1984 roku PDG miała wybrać nowego lidera. Ta osoba byłaby jedynym kandydatem na prezydenta zgodnie z konstytucją. Jednak pułkownicy Lansana Conté i Diarra Traoré przejęli kontrolę w bezkrwawym zamachu stanu zaledwie kilka godzin przed konferencją. Traoré pełnił funkcję premiera do grudnia, kiedy to Conté objął stanowisko prezydenta.
Conté szybko potępił sytuację w zakresie praw człowieka poprzedniego reżimu, uwolnił 250 więźniów politycznych i wezwał kolejne 200,000 2016 osób do powrotu z wygnania. Wyjaśnił też, że odchodzi od socjalizmu, chociaż to nie złagodziło biedy, a naród nie wykazywał żadnych oznak postępu w kierunku demokracji.
Conté ogłosił przywrócenie rządów cywilnych w 1992 roku, z wyborami prezydenckimi w 1993 i wyborami parlamentarnymi w 1995. (w których jego partia – Partia Jedności i Postępu – zdobyła 71 ze 114 mandatów). deklarowane przywiązanie do demokracji. Alpha Condé, lider opozycji, został uwięziony we wrześniu 2001 roku za zagrażanie bezpieczeństwu narodowemu, ale został zwolniony osiem miesięcy później. Następnie udał się na emigrację do Francji.
Conté zaplanował i wygrał referendum w sprawie przedłużenia kadencji prezydenckiej w 2001 roku, a trzecią kadencję rozpoczął w 2003 roku, kiedy opozycja zbojkotowała sondaże. Conté uniknął podejrzenia o próbę zabójstwa w styczniu 2005 r., występując publicznie w Conakry, stolicy Gwinei. Jego krytycy nazywali go „znużonym tyranem”, którego śmierć była nieunikniona, podczas gdy jego zwolennicy myśleli, że wygrywa wojnę z dysydentami. Gwinea nadal stoi przed poważnymi wyzwaniami i, zgodnie z polityką zagraniczną, jest na skraju przekształcenia się w państwo upadłe.
Kiedy rebelianci przekroczyli granice z Liberią i Sierra Leone w 2000 roku, Gwinea wplątała się w niestabilność, która od dawna nękała resztę Afryki Zachodniej i przez chwilę wydawało się, że naród znajduje się na skraju wojny domowej. Conté twierdził, że sąsiedzi przywódcy zazdroszczą bogactwom naturalnym Gwinei, ale zarzuty te zostały stanowczo odrzucone. W 2003 roku Gwinea zgodziła się na porozumienia z sąsiadami w celu zwalczania rebeliantów. W 2007 roku wybuchły protesty przeciwko administracji, których kulminacją była nominacja nowego premiera.
