8. maja 1530 je Luis de Moscoso Alvarado ustanovil zaselek San Miguel de la Frontera (Sveti Mihael na meji) kot obrambo pred kraljestvom Lenca Chaparrastique (Kraj čudovitih orhidej). Do leta 1586 je bilo naselje povzdignjeno v mesto.
Vulkanski izbruh je leta 1655 skoraj opustošil mesto. Po ljudskem izročilu je bilo uničenje tako strašno, da se je ohranila le slika Satana v župnijski cerkvi.
Kmetijska, tekstilna in kemična industrija Salvadorja je bila osredotočena v tem mestu. Storitvena industrija, zlasti zdravstvena oskrba in trgovina, je od zgodnjega enaindvajsetega stoletja močno narasla, kar je povzročilo velike zasebne naložbe v bolnišnice in trgovska središča po mestu. To je bilo deloma pripisano velikemu znesku nakazil (vsaj 35 odstotkov celotnega zneska ali približno 18 odstotkov nacionalnega BDP), ki jih Salvadorci, ki živijo v tujini, pošiljajo svoji družini v vzhodnem območju države.
Pričakuje se, da se bodo prihodki in bogastvo vzhodne polovice države povečali zaradi novih zaposlitev in podjetij, povezanih z razvojem Puerto La Unión, ki je začel delovati leta 2012.
V mestu so različne zasebne in javne izobraževalne ustanove, vključno z nekaterimi najstarejšimi šolami v državi. Državna univerza Salvadorja (s svojo Facultad Multidiciplinaria de Oriente) in zasebna Universidad de Oriente sta dve veliki univerzi (UNIVO). Univerza Gerardo Barrios, Univerza Modular Abierta.
Od začetka desetletja je bila športna infrastruktura v San Miguelu obsežno zgrajena in prenovljena. Nacionalni nogometni stadion »Juan Francisco Barraza«, »Polideportivo Don Bosco« in stadion Charlaix so glavna športna prizorišča.
San Miguel ima novembra občinska praznovanja v čast »Nuestra Seora De La Paz« (Naše Gospe miru), pri čemer je karneval San Miguel glavni dogodek zadnjo soboto v mesecu. To je največji festival zabave, glasbe in kulinarike v Salvadorju in eden največjih v Srednji Ameriki, ki se ga ob 1,000,000. obletnici udeleži približno 50 ljudi (kot poročajo lokalni mediji). Začetki karnevala segajo v leto 1959. Trenutno ta tradicija še naprej predstavlja širitev mesta in je eden od gospodarskih gonil mesta.
San Miguel je znan po živahnem nočnem življenju ob aveniji Roosevelt, glavni mestni žili. Katedrala »Nuestra Seora de la Paz« (1862), Guzmanov park, gledališče Francisco Gavidia (1909) in Palacio Municipal se nahajajo v enem od teh delov (1935). Sodobni San Miguel na drugi strani obsega nove skupnosti, znane kot »kolonije«.
Kapitan general Gerado Barrios, pisatelj Francisco Gavidia, pesnik Juan J. Caas in David Joaqun Guzmán so med slavnimi domorodci San Miguela. Mesto je obkroženo z vulkanom Chaparrastique (2,129 metrov), ki je nedvomno najbolj nepozabna znamenitost San Miguela.
