Tokyo vanta la più grande economia metropolitana del mondo. Tokyo ospita 51 delle 500 aziende Global, circa il doppio del numero della seconda città (Parigi).
Tokyo è un importante centro finanziario mondiale che ospita la sede di alcune delle principali banche di investimento e compagnie assicurative del mondo, nonché un hub per i settori dei trasporti, dell'editoria, dell'elettronica e della radiodiffusione del Giappone. Durante lo sviluppo economico del dopoguerra giapponese, diverse importanti società trasferirono la loro sede da località come Osaka (lo storico centro commerciale) a Tokyo per avere un maggiore accesso al governo. Questa tendenza ha iniziato a decelerare a causa della continua espansione della popolazione di Tokyo e dell'alto costo della vita.
L'Economist Intelligence Unit ha classificato Tokyo come la città più costosa (il più alto costo della vita) al mondo per 14 anni consecutivi, terminando nel 2006.
Tokyo, insieme a New York e Londra, è stata considerata uno dei tre "hub di comando" per l'economia globale.
La Borsa di Tokyo è la più grande borsa valori del Giappone, nonché la terza al mondo in termini di capitalizzazione di mercato e la quarta in termini di rotazione delle azioni.
Anche l'industria del turismo di Tokyo contribuisce all'economia della città. Secondo l'amministrazione di Tokyo, 4.81 milioni di visitatori stranieri e 420 milioni di visitatori giapponesi hanno visitato Tokyo nel 2006, con un valore economico totale di 9.4 trilioni di yen. Molti visitatori visitano i numerosi centri cittadini, le attività commerciali e le aree di intrattenimento nei quartieri speciali di Tokyo; per gli scolari in escursione sul campo è obbligatoria la visita alla Tokyo Tower. Le offerte culturali includono l'onnipresente cultura pop giapponese e distretti associati come Shibuya e Harajuku, nonché attrazioni subculturali come il centro anime Studio Ghibli e musei come il Museo Nazionale di Tokyo, che ospita il 37% dei tesori nazionali delle opere d'arte del paese.
Il mercato ittico di Tsukiji nel centro di Tokyo è il più grande mercato all'ingrosso di pesce e frutti di mare del mondo, nonché uno dei più grandi mercati alimentari all'ingrosso di qualsiasi tipo al mondo. Il mercato di Tsukiji sostiene le tradizioni del suo antenato, il mercato del pesce di Nihombashi, e serve oltre 50,000 acquirenti e venditori ogni giorno. Dettaglianti, grossisti, banditori e semplici residenti partecipano al mercato, producendo un microcosmo unico di caos ordinato che, dopo quattro secoli, continua ad alimentare la città e la sua fornitura di cibo.