Hovedstaden i Sao Tomé og Principe, Sao Tome, er landets desidert største by. Navnet betyr "Saint Thomas" på portugisisk.
Presidentpalasset, kirken og en kino er blant byens attraksjoner. Skoler, ungdomsskoler, videregående skoler, en polyteknisk høyskole, to markeder, tre radiostasjoner, den offentlige TV-stasjonen TVSP, flere klinikker og sykehus, landets hovedflyplass – So Tomé International Airport (med direkte regulære rutefly til Angola, Gabon og Portugal, samt sporadiske innenlandsflyvninger til Prncipe), og mange torg (praças) ligger også i byen.