Marseille ialah pusat komersial dan perindustrian Perancis yang besar dengan infrastruktur transit yang baik (jalan raya, pelabuhan laut dan lapangan terbang). Lapangan Terbang Marseille Provence ialah yang keempat terbesar di Perancis. Marseille telah dinilai sebagai bandar utama Perancis yang paling aktif oleh majalah kewangan Perancis L'Expansion pada Mei 2005, memetik angka yang menunjukkan bahawa 7,200 perniagaan telah ditubuhkan di bandar itu sejak tahun 2000. Marseille juga merupakan pusat penyelidikan kedua terbesar di Perancis, dengan Universiti Aix Marseille menempatkan 3,000 pakar penyelidikan. Kawasan metropolitan Marseille mempunyai KDNK $60.3 bilion pada 2014, atau $36,127 per kapita (pariti kuasa beli).
Port
Ekonomi Marseille dari segi sejarah didorong oleh fungsinya sebagai pelabuhan Empayar Perancis yang menghubungkan milik Afrika Utara Algeria, Maghribi, dan Tunisia dengan Metropolitan Perancis. Semasa Empayar Kedua, Pelabuhan de la Joliette menggantikan Pelabuhan Lama sebagai pelabuhan perdagangan utama, dan pada masa ini menempatkan restoran, pejabat, bar dan hotel, serta berfungsi terutamanya sebagai marina persendirian. Majoriti pelabuhan dan dok, yang merosot pada 1970-an semasa krisis minyak, baru-baru ini telah diubah suai menggunakan subsidi Kesatuan Eropah. Memancing masih penting di Marseille, dan hasil tangkapan tempatan memberi makan kepada ekonomi makanan bandar; pasar ikan harian masih dijalankan di Quai des Belges di Pelabuhan Lama.
Ekonomi dan kawasan Marseille masih terikat erat dengan pelabuhan komersialnya, pelabuhan Perancis pertama dan pelabuhan Eropah keenam mengikut tan kargo, yang terletak di utara Pelabuhan Lama dan timur Fos-sur-Mer. Operasi pelabuhan menyokong sekitar 45,000 pekerjaan dan menjana 4 bilion euro kepada ekonomi kawasan. Pelabuhan itu mengendalikan 100 juta tan kargo setiap tahun, 60 peratus daripadanya adalah petroleum, meletakkannya di tempat pertama di Perancis dan Mediterranean dan ketiga di Eropah. Walau bagaimanapun, pada awal 2000-an, mogok berterusan dan pergolakan sosial menghalang pembangunan dalam trafik kontena. Dengan 1,062,408 TEU, pelabuhan itu menduduki tempat ke-20 di Eropah untuk trafik kontena, dan infrastruktur baharu telah meningkatkan kapasiti kepada 2M TEU. Industri utama ialah penapisan petroleum dan pembinaan kapal, walaupun bahan kimia, sabun, kaca, gula, bahan binaan, plastik, tekstil, minyak zaitun, dan makanan diproses juga merupakan barangan utama. Marseille dihubungkan dengan Rhône melalui terusan, memberikannya akses ke rangkaian laluan air yang besar di Perancis. Talian paip mengangkut petroleum ke utara ke lembangan Paris. Selain itu, bandar ini merupakan pusat penapisan minyak utama Perancis.