Η Γκουανταλαχάρα είναι η τρίτη μεγαλύτερη οικονομία και βιομηχανική υποδομή του Μεξικού, αντιπροσωπεύοντας το 37% του συνολικού ακαθάριστου εγχώριου προϊόντος του Χαλίσκο. Η οικονομική του βάση είναι ισχυρή και ποικιλόμορφη, επικεντρωμένη κυρίως στο εμπόριο και τις υπηρεσίες, ωστόσο η μεταποίηση παίζει σημαντικό ρόλο. Περιλαμβάνεται μεταξύ των 10 κορυφαίων οικονομιών στη Λατινική Αμερική και τρίτη στο Μεξικό όσον αφορά το ακαθάριστο εγχώριο προϊόν. Στην δημοσκόπησή του το 2007, «Cities of the Future», το περιοδικό FDi βαθμολόγησε τη Γκουανταλαχάρα πρώτη μεταξύ των μεγάλων πόλεων του Μεξικού και την ονόμασε με το δεύτερο υψηλότερο οικονομικό δυναμικό από οποιαδήποτε άλλη μεγάλη πόλη της Βόρειας Αμερικής, μετά το Σικάγο. Το 2007, η FDI την ανακήρυξε ως την καλύτερη φιλική προς τις επιχειρήσεις πόλη στη Λατινική Αμερική.
Η Moody's Investors Service εξέδωσε αξιολογήσεις της Moody's Investors Service Ba1 (παγκόσμια κλίμακα, τοπικό νόμισμα) και A1.mx το 2009. (εθνική κλίμακα του Μεξικού). Οι οικονομικές επιδόσεις του δήμου ήταν ασυνεπείς τα τελευταία πέντε χρόνια, αλλά είχαν αρχίσει να σταθεροποιούνται τα τελευταία δύο χρόνια. Η Γκουανταλαχάρα έχει έναν από τους μεγαλύτερους δημοτικούς προϋπολογισμούς στο Μεξικό και ο δείκτης κατά κεφαλήν εσόδων της (Ψ. 2,265 $) είναι υψηλότερος από τον εθνικό μέσο όρο για τις πόλεις που αξιολογούνται από τον Moody's.
Η οικονομία της πόλης χωρίζεται σε δύο διακριτά τμήματα. Το εμπόριο και ο τουρισμός απασχολούν την πλειοψηφία των ανθρώπων, αντιπροσωπεύοντας περίπου το 60% του εργατικού δυναμικού. Η άλλη είναι η βιομηχανία, η οποία υπήρξε η κινητήρια δύναμη της οικονομικής επέκτασης και το θεμέλιο της εθνικής οικονομικής σημασίας της Γκουανταλαχάρα, ενώ απασχολούσε λιγότερο από το ένα τρίτο του πληθυσμού. Οι βιομηχανίες σε αυτήν την περιοχή κατασκευάζουν μια ποικιλία αγαθών, όπως τρόφιμα και ποτά, παιχνίδια, υφάσματα, ανταλλακτικά αυτοκινήτων, ηλεκτρικό εξοπλισμό, φάρμακα, υποδήματα και έπιπλα. Τα κλωστοϋφαντουργικά προϊόντα και τα υποδήματα είναι δύο από τους πιο σημαντικούς τομείς, και οι δύο είναι επί του παρόντος ζωντανοί και αυξανόμενοι. Το 60% των παραγόμενων προϊόντων πωλείται στην τοπική αγορά, ενώ το 40% εξάγεται, κυρίως στις Ηνωμένες Πολιτείες. Ως αποτέλεσμα, οι οικονομικές περιουσίες της Γκουανταλαχάρα είναι άρρηκτα συνδεδεμένες με αυτές των Ηνωμένων Πολιτειών, τόσο ως πηγή επενδύσεων όσο και ως αγορά για τα προϊόντα της.
Ωστόσο, η πόλη έχει ονομαστεί «Silicon Valley του Μεξικού» από τις βιομηχανίες ηλεκτρονικών και πληροφορικής. Η Γκουανταλαχάρα είναι ο μεγαλύτερος κατασκευαστής λογισμικού, ηλεκτρονικών και ψηφιακών εξαρτημάτων στο Μεξικό. Οι εξαγωγές τηλεπικοινωνιών και εξοπλισμού υπολογιστών της Γκουανταλαχάρα αντιπροσωπεύουν περίπου το ένα πέμπτο των εξαγωγών ηλεκτρονικών ειδών του Μεξικού. Η πόλη και τα προάστια της φιλοξενούν εταιρείες όπως General Electric, IBM, Intel Corporation, Freescale Semiconductor, Hitachi Ltd., Hewlett-Packard, Siemens, Flextronics, Oracle, TCS, Cognizant Technology Solutions και Jabil Circuit. Αυτό το περιστατικό προέκυψε όταν επικυρώθηκε η Συμφωνία Ελεύθερου Εμπορίου της Βόρειας Αμερικής (NAFTA). Διεθνείς εταιρείες άρχισαν να δραστηριοποιούνται στο Μεξικό, ιδιαίτερα στη Γκουανταλαχάρα, αντικαθιστώντας τις εγχώριες, ιδίως στην τεχνολογία της πληροφορίας. Μία από τις συνέπειες αυτού είναι ότι κατά τη διάρκεια της οικονομικής ύφεσης, οι μεγάλες πολυεθνικές εταιρείες μειώνουν τις δραστηριότητές τους.
Η Γκουανταλαχάρα, σύμφωνα με το περιοδικό fDi, έχει το δεύτερο υψηλότερο οικονομικό δυναμικό από οποιαδήποτε μεγάλη μητρόπολη της Βόρειας Αμερικής, μετά μόνο το Σικάγο. Η Γκουανταλαχάρα αναγνωρίστηκε ως «πόλη του μέλλοντος» στην ίδια μελέτη λόγω του νεαρού πληθυσμού της, του χαμηλού ποσοστού ανεργίας και του μεγάλου όγκου πρόσφατων συναλλαγών ξένων επενδύσεων. Αναγνωρίστηκε επίσης ως η τρίτη πιο φιλική προς τις επιχειρήσεις πόλη της Βόρειας Αμερικής.
Η πόλη πρέπει να ανταγωνιστεί την Κίνα, ιδιαίτερα σε επιχειρήσεις όπως ηλεκτρονικά που εξαρτώνται από μεγάλο όγκο και φθηνούς μισθούς. Ως αποτέλεσμα, έχει στρέψει το ενδιαφέρον της σε υπηρεσίες υψηλού μείγματος, μεσαίου όγκου και προστιθέμενης αξίας, όπως τα αυτοκίνητα. Ωστόσο, το παραδοσιακό πλεονέκτημα της Γκουανταλαχάρα ως προς την εγγύτητα με την αγορά των ΗΠΑ τη βοηθά να παραμείνει ανταγωνιστική. Το Μεξικό ήταν τρίτο στη Λατινική Αμερική το 2009 όσον αφορά τις εξαγωγές υπηρεσιών πληροφορικής, μετά μόνο τη Βραζιλία και την Αργεντινή. Αυτό το είδος υπηρεσίας αφορά κυρίως την παροχή τεχνικής βοήθειας μέσω email και τηλεφώνου. Το πρωταρχικό ζήτημα που αντιμετωπίζει αυτή η βιομηχανία είναι η έλλειψη αγγλόφωνων αποφοίτων πανεπιστημίου.
