Το Ναγκασάκι είναι η πρωτεύουσα και μεγαλύτερη πόλη του νομού Ναγκασάκι στο ιαπωνικό νησί Kyushu. Υπήρξε κέντρο πορτογαλικής και ολλανδικής επιρροής από τον 16ο έως τον 19ο αιώνα και οι εκκλησίες και οι χριστιανικοί χώροι του Ναγκασάκι έχουν προταθεί για συμπερίληψη στον Κατάλογο Παγκόσμιας Κληρονομιάς της UNESCO. Κατά τη διάρκεια του Πρώτου Σινο-Ιαπωνικού Πολέμου και του Ρωσο-Ιαπωνικού πολέμου, μια μεγάλη βάση του Αυτοκρατορικού Ιαπωνικού Ναυτικού βρισκόταν στο Ναγκασάκι. Το όνομά του μεταφράζεται ως "μακριά κάπα".
Κατά τη διάρκεια του Β' Παγκοσμίου Πολέμου, οι αμερικανικές ατομικές βόμβες της Χιροσίμα και του Ναγκασάκι κατέστησαν το Ναγκασάκι τη δεύτερη και, μέχρι σήμερα, μοναδική πόλη στον κόσμο που δέχθηκε πυρηνική επίθεση.
Από την 1η Ιανουαρίου 2009, η πόλη έχει εκτιμώμενο πληθυσμό 446,007 κατοίκους και πυκνότητα πληθυσμού 1,100 άτομα ανά τετραγωνικό χιλιόμετρο. Ολόκληρη η χερσαία έκταση είναι 406.35 km2.