8 Mayıs 1530'da Luis de Moscoso Alvarado, Lenca krallığı Chaparrastique'e (Güzel Orkideler Yeri) karşı bir savunma olarak San Miguel de la Frontera (Sınırdaki Aziz Michael) mezrasını kurdu. 1586'da yerleşim bir şehir statüsüne yükseltildi.
1655'te bir volkanik patlama şehri neredeyse harap etti. Halkbilimine göre yıkım o kadar korkunçtu ki, sadece bölge kilisesindeki Şeytan'ın bir resmi korunabildi.
El Salvador'un tarım, tekstil ve kimya endüstrilerinin tümü bu şehirde toplanmıştır. Hizmet sektörü, özellikle sağlık ve ticaret, yirmi birinci yüzyılın başlarından bu yana önemli ölçüde büyümüş ve şehir çevresindeki hastanelere ve perakende alışveriş merkezlerine büyük özel yatırımlar yapılmasına neden olmuştur. Bu, kısmen yurtdışında yaşayan Salvadorluların ülkenin doğu bölgesindeki ailelerine gönderdikleri büyük miktardaki havalelere (toplamın en az yüzde 35'i veya ulusal GSYİH'nın kabaca yüzde 18'i) bağlanıyor.
Ülkenin gelirlerinin ve servetinin doğu yarısının, 2012 yılında faaliyete geçen Puerto La Unión'un gelişimi ile ilgili yeni istihdam ve girişimler sonucunda artması bekleniyor.
Şehirde, ülkenin en eski okullarından bazıları da dahil olmak üzere çeşitli özel ve kamu eğitim kurumları bulunmaktadır. Devlet El Salvador Üniversitesi (Facultad Multidiciplinaria de Oriente ile) ve özel Universidad de Oriente iki büyük üniversitedir (UNIVO). Gerardo Barrios Üniversitesi, Üniversite Modüler Abierta.
On yılın başından beri, San Miguel'in spor altyapısı büyük bir inşaat ve yenileme sürecinden geçti. “Juan Francisco Barraza” ulusal futbol stadyumu, “Polideportivo Don Bosco” ve Charlaix Stadyumu, başlıca spor mekanlarıdır.
San Miguel, Kasım ayında “Nuestra Seora De La Paz” (Barış Leydimiz) onuruna belediye kutlamalarına sahiptir ve San Miguel Karnavalı, ayın son Cumartesi günü ana olaydır. El Salvador'daki en büyük eğlence, müzik ve mutfak festivali ve Orta Amerika'nın en büyüklerinden biri ve 1,000,000. yıl dönümü için tahmini 50 kişi (yerel medyada bildirildiği gibi). Karnaval'ın kökenleri 1959'a kadar uzanabilir. Şu anda, bu gelenek şehrin genişlemesini temsil etmeye devam ediyor ve şehrin ekonomik itici güçlerinden biri.
San Miguel, şehrin ana arteri olan Roosevelt Bulvarı'ndaki hareketli gece hayatıyla tanınır. “Nuestra Seora de la Paz” Katedrali (1862), Guzman Parkı, Francisco Gavidia Tiyatrosu (1909) ve Palacio Municipal, hepsi bu bölümlerden birinde yer almaktadır (1935). Modern San Miguel ise "koloniler" olarak bilinen yeni topluluklardan oluşuyor.
Yüzbaşı General Gerado Barrios, yazar Francisco Gavidia, şair Juan J. Caas ve David Joaqun Guzmán ünlü San Miguel yerlileri arasındadır. Şehir, şüphesiz San Miguel'in en unutulmaz manzarası olan Volcan Chaparrastique (2,129 metre) ile çevrilidir.
