Mostar'ın ekonomisi esas olarak alüminyum ve metal endüstrileri, bankacılık ve telekomünikasyona dayanmaktadır. Ülkenin önde gelen şirketlerinden bazılarının merkezleri şehirde bulunuyor.
Mostar, Saraybosna ile birlikte Bosna-Hersek'teki en büyük finans merkezidir ve ülkenin en büyük üç bankasından ikisinin merkezi buradadır. Bosna-Hersek'te, biri Mostar'da olmak üzere üç ulusal elektrik, posta ve telekomünikasyon hizmeti şirketi vardır (elektrik hizmeti şirketi 'Elektroprivreda HZHB,' posta hizmeti işletmesi Hrvatska Pota Mostar ve ülkenin en büyük üçüncü telekomünikasyon firması olan HT Mostar). Bu üç işletme (bankalar ve bir alüminyum dökümhanesi ile birlikte) şehrin toplam ekonomik faaliyetinin önemli bir bölümünü oluşturmaktadır. Son birkaç yılda, özel sektör, uygun iş ortamına katkıda bulunan küçük ve orta ölçekli işletmelerde önemli bir genişleme yaşadı.
Mostar şehri bölgesinde üç barajın varlığı göz önüne alındığında, şehir gelecekteki endüstriyel genişleme için sağlam bir temele sahiptir. Rüzgar enerjisinin potansiyel kullanımı ve yel değirmenlerinin inşası için de devam eden bir girişim var.
Mostar, 1992-1995 Bosna Savaşı'ndan önce kapatılan, yıkılan veya küçülen diğer önemli işletmelere bağımlıydı. Bunlar arasında SOKO (askeri uçak fabrikası), Fabrika duhana Mostar (tütün işi) ve Hepok (gıda endüstrisi) vardı. Mostar'ın 1981'de kişi başına düşen GSYİH'si Yugoslav ortalamasının yüzde 103'ü idi.
Aluminij, eski Yugoslavya'da halen faaliyette olan tek kuruluştur. Aluminij, bir dizi yabancı ortakla ülkedeki en güçlü firmalardan biridir. Şirketin yıllık üretimi hızla artıyor ve Daimler Chrysler ve Fiat gibi dünya çapında önemli firmalarla ortaklık kuruyor. Aluminij şehirdeki, bölgedeki ve ülkedeki en güçlü işletmelerden biridir. Mevcut endüstriyel kapasite ile ilgili olarak, yıllık ihracatta 150 milyon Euro'nun üzerinde üretim yapmaktadır. Aluminij'in ortakları arasında, en önemlileri: Amerika Birleşik Devletleri'nden Venture Coke Company LLC (Venco-Conoco ortak Girişimi), İsviçre'den Glencore International AG, Debis International trading GmbH, Daimler-Chrysler ve VAW Aluminium olan tanınmış küresel şirketler bulunmaktadır. Almanya'dan Technologie GmbH, Norveç'ten Hydro ASA, İtalya'dan Fiat ve Hırvatistan'dan TLM-ibenik. Aluminij, yalnızca Mostar bölgesi için her yıl 40 milyon € gelir elde ediyor.
Mostar ayrıca 1997'de başlayan iki yılda bir düzenlenen Mostar Uluslararası Ekonomi Fuarı'na (“Meunarodni sajam gospodarstva Mostar”) ev sahipliği yapmaktadır. Fuar çeşitli bölümlere ayrılmıştır: “Ekonomi Fuarı”, “Şarap Fuarı”, “Kitap Fuarı” ve “Yemek Günü.”