บิสเซาเป็นเมืองหลวงของกินี-บิสเซา บิสเซา เมืองของกินีบิสเซา ท่าเรือสำคัญ และศูนย์กลางการบริหารและการทหาร ตั้งอยู่บนปากแม่น้ำเกบา นอกมหาสมุทรแอตแลนติก
บิสเซามีภูมิอากาศแบบทุ่งหญ้าสะวันนาเขตร้อน ซึ่งเปียกมากกว่าภูมิอากาศแบบอื่นๆ แต่ไม่เปียกเกือบเท่าสภาพอากาศแบบมรสุมเขตร้อน
ตั้งแต่เดือนพฤศจิกายนถึงพฤษภาคม จะมีฝนตกเพียงเล็กน้อย แม้ว่าเมืองจะมีฝนตกประมาณ 2,020 มม. (80 นิ้ว) ตลอดห้าเดือนที่เหลือของปี ความชื้นสูงทำให้รู้สึกไม่สบายตัวจากความร้อนรุนแรงในฤดูฝน และแม้กระทั่งเมื่อสามเดือนก่อน
บิสเซาตั้งอยู่บนปากแม่น้ำเกบา นอกมหาสมุทรแอตแลนติก ที่ 11°52′ เหนือ, 15°36′ ตะวันตก (11.86667, -15.60) พื้นดินรอบ ๆ บิสเซาเป็นที่ราบต่ำเป็นพิเศษ และแม่น้ำแม้ว่าจะมีกระแสน้ำไหลน้อย แต่ก็สามารถแล่นเรือได้โดยเรือเดินทะเลเป็นระยะทางประมาณ 80 กิโลเมตร (50 ไมล์) นอกเมือง
บิสเซาเป็นเมืองหลักของประเทศ ซึ่งเป็นท่าเรือที่สำคัญ รวมทั้งเป็นศูนย์กลางด้านการศึกษา การบริหาร และการทหารของประเทศ