Zakynthos a Jón-tenger keleti részén található, körülbelül 20 kilométerre (12 mérföldre) nyugatra a görög (Peloponnészosz) félszigettől. Kefalonia körülbelül 15 kilométerre (9 mérföldre) északra található. A jón-tengeri szigetek legdélebbi csoportja (a távoli Kythirát nem számítva). Zakynthos körülbelül 40 kilométer hosszú és 25 kilométer széles, teljes területe 20 km12 (405.55 négyzetmérföld). Partvonala körülbelül 2 kilométeren (156.58 mérföldön) húzódik. A sziget lakossága a 123-es népszámlálás szerint 76 40,759 fő. A legmagasabb csúcs a Vrachionas, 2011 méter magas.
Zakynthos szigete nyílhegy alakú, a „csúcs” (Skinari-fok) északnyugat felé mutat. A sziget nyugati fele egy magas fennsík, míg a délnyugati part elsősorban éles sziklákból áll. A keleti oldal egy sűrűn lakott, termékeny síkság hosszú homokos strandokkal, amelyet néhány elszigetelt domb tagol fel, ezek közül a legjelentősebb Bochali, amely a városra és északkeleten a Vasilikos-félszigetre néz. Az északi Vassilikos és a déli Marathia félszigetek veszik körül Laganas hatalmas és sekély kikötőjét a sziget délkeleti részén.
A fővárosként Zakynthos városa szolgál, amelynek neve megegyezik a prefektúrával. Az északi part legkeletibb pontján található. A hivatalos néven kívül Chora néven is ismert (azaz a város, amely közös elnevezés Görögországban, amikor maga a sziget neve megegyezik a fő város nevével). Zakynthos kikötőjét komp köti össze a szárazföldi Kyllini kikötővel. Egy másik hajó összeköti Agios Nikolaos falucskát a kefaloni Argostoli várossal. Marathonisi, Pelouzo és Agios Sostis a Laganas-öbölben; Agios Nikolaos, a névadó kikötőben az északi ponton; és Agios Ioannis Porto Vromi közelében a nyugati parton kisebb lakatlan szigetek, amelyek a településhez és a regionális egységhez tartoznak.
Flóra és fauna
A sziget sűrű növényzete a sziget mérsékelt mediterrán éghajlatának és a bőséges téli csapadéknak az eredménye. Az olívaolaj, a ribizli, a szőlő és a citrusfélék a fő mezőgazdasági termékek. A Zante ribizli egy kis finom mag nélküli szőlő, amely a szigeten honos. A Laganas-öböl ad otthont a Földközi-tenger első Nemzeti Tengeri Parkjának, és jó szaporodási élőhelye a tengeri teknősöknek (Caretta caretta). A Laganas-öböl fészkelőhelyként súlyosan veszélyeztetett volt az 1980-as évek elején, de nagyrészt a MEDASSET alapítója és elnöke, Lily Venizelos erőfeszítéseinek köszönhetően sikerült megmenteni. A Caretta caretta kritikusan veszélyeztetett faj, amelyet súlyosbít a párzási helyükön található nyugágyak és az azt követő szennyezés. Minden év június elején a nőstény teknősök a déli strandokra mennek, hogy tojásaikat a homokra rakják.
A fészek lappangási ideje körülbelül 55 nap, ezt követően a fiókák kiszöknek a fészekből, és a tengerbe vonulnak. Túlélési arányuk nagyon alacsony; a vízbe kerülő ezer fiókából csak egy marad életben. Minden fészek körülbelül száz-százhúsz tojást tartalmaz, mindegyik körülbelül egy pingponglabda méretű és alakú. A nőstény teknősök húsz és harminc éves koruk között kezdenek tojást rakni.