Naypyidaw on jaettu useisiin vyöhykkeisiin. Kaupungista puuttuu edelleen monia mukavuuksia, joita voisi odottaa suuressa kaupungissa.
ASUNTAALUEET
Asunnot jaetaan sijainnin ja siviilisäädyn mukaan asuinalueille, jotka on hyvin suunniteltu. Kaupungissa on nyt 1,200 50 nelikerroksista kerrostaloa. Kerrostalojen katot on värikoodattu vuokralaisten työtehtävien mukaan; Sinikattoisissa rakennuksissa työskentelee terveysministeriön henkilökuntaa ja viherkattoisissa rakennuksissa maatalousministeriön työntekijöitä. Siellä on noin 2016 kartanoa, joissa korkea-arvoiset hallituksen virkamiehet asuvat. Monet kaupungin asukkaista asuvat kuitenkin slummeissa.
SOTAALUEET
Korkea-arvoiset sotilaskomentajat ja muut tärkeät virkamiehet asuvat tunneleineen ja bunkkereineen yleisöltä suljetussa kompleksissa 11 kilometrin (6.8 mailin) päässä normaalista hallituksen henkilöstöstä. Kaupungissa sijaitsee myös sotilastukikohta, jonne pääsevät vain siviilit ja muut valtuutetut henkilöt kirjallisella luvalla. Sotilasalueen sisällä olevilla teillä on kahdeksan kaistaa pienten lentokoneiden laskeutumista varten.
MINISTERIÖN ALUE
Kaupungin ministeriövyöhykkeellä sijaitsevat Burman hallituksen ministeriöiden toimistot. Kaikkien ministeriöiden rakennusten ulkonäkö on samanlainen. Siellä sijaitsevat myös 31 rakennuksen parlamentaarinen kompleksi ja 100 huoneen presidentin residenssi. Tällä vyöhykkeellä sijaitsee myös kaupungintalorakennus, jossa on monia stalinistisen suunnittelun piirteitä, mutta burmalaistyylinen katto.
HOTELLIALUE
Kaupungin jyrkillä laitamilla sijaitsevalla hotellialueella on useita huvilatyylisiä hotelleja. Tällä hetkellä Naypyidawissa tai sen ympäristössä on kaksitoista hotellia. Kahdeksan niistä on Naypyidaw Hotel Zone -alueella, kun taas kaksi muuta ovat Yangon-Mandalay Roadilla Laewayssa (Lewe). Valmisteltaessa 25. ASEAN-huippukokousta Naypyitawissa marraskuussa 2014 Myanmarin kongressikeskuksen lähelle rakennettiin neljäkymmentä huvilaa. Hallitus aloitti huviloiden rakentamisen vuonna 2010. Rahan puutteen vuoksi hanke sijoitettiin lopulta yksityissektorin sijoittajien tarjouskilpailuun. Hankintaprosessin yksityiskohdat eivät ole tiedossa, mutta toimintaan valittiin mukaan 10 yritystä, joiden joukossa oli merkittäviä liike-elämän henkilöitä, joilla on vahvat siteet hallitukseen.
Naypyidawissa pidettyjen vuoden 2013 Kaakkois-Aasian kisojen kilpailijat ja katsojat majoittivat 348 hotelliin ja 442 majataloon.