Guadalajara er Mexicos tredjestørste økonomi og industrielle infrastruktur, der tegner sig for 37% af staten Jaliscos samlede bruttonationalprodukt. Dets økonomiske grundlag er robust og mangfoldigt, hovedsagelig centreret om handel og tjenesteydelser, men fremstilling spiller en væsentlig rolle. Det er opført blandt top 10 økonomier i Latinamerika og tredje i Mexico med hensyn til bruttonationalproduktet. I deres meningsmåling fra 2007, "Cities of the Future", bedømte FDi-magasinet Guadalajara som den første blandt de store mexicanske byer og udnævnte det til at have det næsthøjeste økonomiske potentiale af enhver større nordamerikansk by, efter Chicago. I 2007 udnævnte FDI den til den bedste forretningsvenlige by i Latinamerika.
Moody's Investors Service udstedte Moody's Investors Service-rating på Ba1 (global skala, lokal valuta) og A1.mx i 2009. (Mexicansk national skala). Kommunens økonomiske resultater havde været inkonsistente gennem de foregående fem år, men var begyndt at stabilisere sig i de sidste to år. Guadalajara har et af de største kommunale budgetter i Mexico, og dets indtægtsindikator pr. indbygger (Ps. $2,265) er højere end landsgennemsnittet for Moody's-bedømte byer.
Byens økonomi er opdelt i to adskilte segmenter. Handel og turisme beskæftiger størstedelen af befolkningen, der tegner sig for omkring 60 % af arbejdsstyrken. Den anden er industrien, som har været motoren bag den økonomiske ekspansion og grundlaget for Guadalajaras nationale økonomiske betydning, mens den har beskæftiget mindre end en tredjedel af befolkningen. Industrier i denne region fremstiller en række varer, herunder mad og drikkevarer, legetøj, tekstiler, bildele, elektrisk udstyr, medicin, fodtøj og møbler. Tekstiler og fodtøj har været to af de vigtigste sektorer, og begge er i øjeblikket levende og stigende. 60% af de producerede varer sælges på det lokale marked, mens 40% eksporteres, mest til USA. Som følge heraf er Guadalajaras økonomiske formuer uløseligt forbundet med USAs, både som en kilde til investeringer og som et marked for dets produkter.
Byen er dog blevet døbt "Silicon Valley of Mexico" af elektronik- og informationsteknologiindustrien. Guadalajara er Mexicos største producent af software, elektronik og digitale komponenter. Guadalajaras eksport af tele- og computerudstyr udgør omkring en femtedel af Mexicos elektronikeksport. Byen og dens forstæder er hjemsted for virksomheder som General Electric, IBM, Intel Corporation, Freescale Semiconductor, Hitachi Ltd., Hewlett-Packard, Siemens, Flextronics, Oracle, TCS, Cognizant Technology Solutions og Jabil Circuit. Denne hændelse opstod, da den nordamerikanske frihandelsaftale blev ratificeret (NAFTA). Internationale virksomheder begyndte at etablere aktiviteter i Mexico, især i Guadalajara, og erstattede indenlandske, især inden for informationsteknologi. En af konsekvenserne af dette er, at store multinationale selskaber under økonomiske nedgangstider reducerer deres aktiviteter.
Guadalajara har ifølge magasinet fDi det næsthøjeste økonomiske potentiale af enhver større nordamerikansk metropol, efter kun Chicago. Guadalajara blev identificeret som en "fremtidens by" i den samme undersøgelse på grund af dens unge befolkning, lave arbejdsløshedsprocent og store mængder af nylige udenlandske investeringstransaktioner; den blev også identificeret som Nordamerikas tredje mest forretningsvenlige by.
Byen skal konkurrere med Kina, især i virksomheder som elektronik, der er afhængige af store mængder og billige lønninger. Som følge heraf har det flyttet sit fokus til høj-mix, mellemvolumen og værdiskabende tjenester, såsom biler. Men Guadalajaras traditionelle fordel ved at være tæt på det amerikanske marked hjælper det med at forblive konkurrencedygtigt. Mexico var tredje i Latinamerika i 2009 med hensyn til eksport af informationsteknologitjenester, efter kun Brasilien og Argentina. Denne form for service er for det meste beskæftiget med at yde teknisk hjælp via e-mail og telefon. Det primære problem, som denne industri står over for, er mangel på engelsktalende universitetsuddannede.