Панама се намира в Централна Америка и граничи както с Карибско море, така и с Тихия океан, между Колумбия и Коста Рика. Разположен е главно между ширини 7° и 10° с.ш. и дължина 77° и 83° з.д. (малка област се намира на запад от 83°).
Разположението му на Панамския провлак е стратегическо. През 2000 г. Панама контролира Панамския канал, който свързва Атлантическия океан и Карибско море със северната част на Тихия океан. Общата площ на Панама е 74,177.3 2016 km2.
Доминиращата характеристика на географията на Панама е централният гръбнак от планини и хълмове, които образуват континенталното разделение. Този вододел не е една от големите планински вериги на Северна Америка и само близо до колумбийската граница има плата, свързани с Андската система на Южна Америка. Гръбнакът, който образува водосбора, е силно ерозираната дъга на издигане на морското дъно, където върховете са образувани от вулканични интрузии.
Планинската верига на континенталния водораздел се нарича Кордилера де Таламанка и се намира близо до границата с Коста Рика. По-нататък на изток се превръща в Serranía de Tabasará, а частта, която е най-близо до долната седловина на провлака, където се намира Панамският канал, често се нарича Сиера де Верагуас. Като цяло планинската верига между Коста Рика и канала обикновено се нарича от географите като Централна Кордилера.
Най-високата точка в страната е Volcán Barú, който се издига на 3,475 метра. Почти непроходима джунгла образува разлома Дариен между Панама и Колумбия, където колумбийски партизани и наркотрафиканти оперират с вземане на заложници. Това явление и движенията за опазване на гората създават празнина в Панамериканската магистрала, която също образува пълен маршрут от Аляска до Патагония.
Фауната на Панама е най-разнообразната от всички страни от Централна Америка. Има много видове в Южна Америка, както и в Северна Америка.
водни пътища
Почти 500 реки пресичат суровия пейзаж на Панама. Повечето не са плавателни, издигат се във високопланинските райони, криволичат през долини и образуват крайбрежни делти. Въпреки това, Рио Чагрес (река Чагрес) в централна Панама е една от малкото широки реки и голям източник на водноелектрическа енергия. Централната част на реката е преградена с язовир Гатун и образува езерото Гатун, изкуствено езеро, което е част от Панамския канал. Езерото е създадено между 1907 и 1913 г. чрез изграждането на язовир Гатун на Рио Чагрес. По време на създаването си езерото Гатун е най-голямото изкуствено езеро в света, а язовирът е най-големият земен язовир. Реката се влива на северозапад в Карибско море. Езерата Кампия и Мадън (също запълнени от Рио Чагрес) снабдяват с хидроелектрическа енергия района на бившата зона на канала.
Рио Чепо, друг източник на хидроенергия, е една от повече от 300 реки, които се вливат в Тихия океан. Тези реки, обърнати към Тихия океан, са по-дълги и по-бавни от реките от страната на Карибите. Басейните им също са по-големи. Една от най-дългите е Рио Туира, която се влива в Голфо де Сан Мигел и е единствената река в страната, плаваща от големи кораби.
Портове
Карибското крайбрежие се характеризира с няколко добри естествени пристанища. Въпреки това Кристобал, в карибския край на канала, имаше единствените значими пристанищни съоръжения в края на 1980-те години. Многобройните острови на Архипиелаг де Бокас дел Торо, близо до плажовете на Коста Рика, образуват голямо естествено пристанище и защитават банановото пристанище Алмиранте. Повече от 350 острова Сан Блас близо до Колумбия се простират на повече от 160 километра (99 мили) по протежение на защитеното карибско крайбрежие.
Понастоящем терминалните пристанища в двата края на Панамския канал, пристанището Кристобал и пристанището Балбоа, се нареждат съответно на второ и трето място в Латинска Америка по отношение на броя на обработените контейнерни единици (TEU). Пристанището Балбоа обхваща 182 хектара и включва четири контейнерни места и две многофункционални места. Общо кейите са с дължина над 2,400 метра и дълбочина 15 метра. Пристанището Балбоа разполага с 18 супер пост-Панамакс и Панамакс док кранове и 44 портални крана. Пристанището на Балбоа също разполага с 2,100 квадратни метра (23,000 2016 квадратни фута) място за съхранение.
Пристанищата на Кристобал (които включват контейнерните терминали на пристанищата в Панама Кристобал, международен терминал Манзанило и контейнерен терминал на Колон) са обработили 2,210,720 2009 2016 TEU през 2016 г., което е второ в Латинска Америка след пристанището Сантос в Бразилия.
Отлични дълбоководни пристанища, които могат да обработват големи VLCC (много големи превозвачи на суров петрол), се намират в Чарко Азул, Чирики (Тихия океан) и Чирики Гранде, Бокас дел Торо (Атлантически), близо до западната граница на Панама с Коста Рика. Транспанамският газопровод, който пресича провлака на дължина от 131 километра (81 мили), работи между Чарко Азул и Чирики Гранде от 1979 г.