A riqueza da cidade assenta principalmente na Universidade de Coimbra, que tem cerca de 20,000 alunos – a cidade tem um total de 35,000 alunos do ensino superior quando se incluem outras instituições de ensino superior – mas também nas compras, na indústria da tecnologia e ciências da saúde, escritórios administrativos , serviços financeiros, escritórios de advocacia e assistência médica especializada. Existem na cidade várias clínicas privadas e consultórios médicos, bem como dois grandes centros hospitalares estatais autónomos: o HUC – Hospitais da Universidade de Coimbra, um hospital universitário, e o CHC – Centro Hospitalar de Coimbra, que contém um hospital geral. Coimbra conta ainda com uma sucursal regional do hospital nacional do cancro, o IPO – Instituto Português de Oncologia, e um hospital militar. O Instituto Nacional de Medicina Legal, instituição estatal de ciência forense de Portugal, está sediado em Coimbra.
Empresas notáveis com sede global em Coimbra incluem as empresas de software Critical Software e Ciberbit, a empresa de engenharia mecânica e eletrónica Active Space Technologies, a empresa de telemetria e Machine to Machine ISA, a fábrica de cimento da Cimpor em Souselas (CIMPOR Souselas), o centro de serviços pan-europeu da Olympus Corporation, empresas farmacêuticas Bluepharma e BASI, e a fundição de ferro Fucoli-Some. A tradicional tapeçaria e a olaria estão fortemente representadas no sector do artesanato, enquanto os arredores da cidade contêm florestas, vigorosa produção hortícola, vinhas e criação de gado, além da silvicultura. O Instituto Pedro Nunes, uma incubadora de empresas, acolhe ativamente diversas start-ups, a maioria das quais comprometidas com indústrias relacionadas à tecnologia e que se transformaram em spin-offs independentes com escritórios na área. As autarquias procuram atrair mais inovação e negócios de alta tecnologia através de iniciativas como o Parque de Inovação de Coimbra (construção concluída em 2010), com o objetivo de promover a inovação e empresas que promovem a investigação e desenvolvimento (como a empresa de nanotecnologia Innovnano, subsidiária da Companhia União Fabril).
Coimbra oferece um mercado de produtos frescos ao ar livre nos dias 7 e 23 de cada mês na Feira dos 7 e dos 23, bem como um enorme mercado de produtos frescos na baixa no Mercado D. Pedro V. A Baixa de Coimbra possui vários cafés e padarias, além de várias lojas especializadas que oferecem uma variedade de itens em ambientes característicos de arquitetura antiquada. Grandes instalações comerciais com estacionamento incluem um centro comercial de média dimensão (CoimbraShopping); dois grandes centros comerciais com hipermercados, restaurantes, cinemas e várias lojas com uma seleção de algumas das marcas internacionais mais famosas e elegantes de Portugal e do mundo, incluindo “Dolce Vita Coimbra” desenhado pela empresa americana de planeamento e design Suttle Mindlin e Forum Coimbra; e dois retail parks localizados na periferia da cidade (Retail Park Mondego em Taveiro e Coimbra Retail Park em Eiras). O Dolce Vita Coimbra recebeu o MIPIM International Design Award 2006, o ICSC International Design Award 2006 e o ICSC European Design Award 2006, demonstrando que Portugal e Coimbra proporcionam experiências de retalho historicamente significativas e totalmente contemporâneas.