Havanna gazdasága sokszínű, a régi ágazatok, például a gyártás, az építőipar, a szállítás és a kommunikáció párhuzamosan léteznek olyan új vagy újjáéledt ágazatokkal, mint a biotechnológia és a turizmus.
A város gazdasága kezdetben helyzete miatt nőtt, így az egyik első nagy kereskedelmi központ az Újvilágban. A cukor és a virágzó rabszolga-kereskedelem eleinte gazdagságot biztosított a városnak, a szabadság után pedig ismert turisztikai célponttá vált. Annak ellenére, hogy Fidel Castro kormánya megpróbálja kiterjeszteni az ipari tevékenységet a sziget körül, Havanna továbbra is az ország iparának legnagyobb részének központja.
A történelmi cukoripar, amely három évszázada a sziget gazdaságának alapja volt, a sziget más részein összpontosul, és az exportszektor mintegy háromnegyedét irányítja. Havannában azonban könnyűipari létesítmények, húscsomagoló üzemek, valamint vegyi és gyógyszeripari vállalkozások koncentrálódnak. Jelentősek az egyéb élelmiszer-feldolgozó ágazatok, mint a hajógyártás, az autógyártás, az alkoholos italgyártás (főleg a rum), a textil- és a dohányáruk, köztük a világhírű Habanos szivar.
Bár a forradalmi kormány különösen Cienfuegos és Matanzas kikötőit javította, Havanna továbbra is Kuba legfontosabb kikötői létesítménye; A kubai import és export 50 százaléka Havannán keresztül érkezik. A kikötő egy jókora halászati ágazatot is kiszolgál.
89-ben a város hivatalosan nyilvántartott munkaerőjének csaknem 2000 százaléka kormányzati szervezeteknél, intézményeknél vagy vállalkozásoknál dolgozott. Átlagosan Havanna rendelkezik a legmagasabb jövedelmi és humán fejlettségi indexekkel az országban. A Szovjetunió bukását követően Kuba újra a turizmust mint jelentős üzletágat hangsúlyozta, ami segítette az ország talpra állását. A turizmus jelenleg Havanna és Kuba fő bevételi forrása.
Annak ellenére, hogy Raul Castro 2011-ben felkarolta a szabad vállalkozást, Havanna gazdasága még mindig felfordulásban van. Bár 2011-ben nőtt a kisvállalkozások száma, sokuk a későbbiekben megszűnt üzlet és pénzhiány miatt a helyi lakosoktól, akiknek átlagos havi keresete 20 dollár.
Az Atlanti-óceán partján fekvő Vedado az 1990-es évek végén az elsődleges üzleti negyed lett. Alapvetően 1930 és 1960 között épült, amikor Havanna az amerikaiak népszerű nyaralóhelyévé vált; sokemeletes szállodák, kaszinók, éttermek és előkelő üzleti létesítmények, amelyek közül sok az art deco stílust tükrözte.
A Vedado ma Havanna pénzügyi központja, ahol a legnagyobb bankok, légitársaságok irodái, üzletei, a legtöbb vállalati székhely, valamint egy csomó sokemeletes ház és szálloda található. Vedado ad otthont a Havannai Egyetemnek.