Nagasaki je glavni i najveći grad prefekture Nagasaki na japanskom otoku Kyushu. Bio je središte portugalskog i nizozemskog utjecaja od 16. do 19. stoljeća, a crkve i kršćanska mjesta u Nagasakiju preporučeni su za uvrštavanje na UNESCO-ov popis svjetske baštine. Tijekom Prvog kinesko-japanskog rata i rusko-japanskog rata u Nagasakiju je bila smještena velika baza japanske carske mornarice. Njegovo ime u prijevodu znači "dugački rt".
Tijekom Drugog svjetskog rata, američke atomske bombe Hirošime i Nagasakija učinile su Nagasaki drugim i do danas jedinim gradom na svijetu nuklearno napadnutim.
Od 1. siječnja 2009. grad ima procijenjenu populaciju od 446,007 ljudi i gustoću naseljenosti od 1,100 ljudi po četvornom kilometru. Ukupna površina zemljišta iznosi 406.35 km2.