Guadalajara on Meksikon kolmanneksi suurin talous ja teollisuusinfrastruktuuri, ja sen osuus Jaliscon osavaltion bruttokansantuotteesta on 37 prosenttia. Sen taloudellinen perusta on vankka ja monipuolinen, keskittyen pääasiassa kauppaan ja palveluihin, mutta teollisuudella on merkittävä rooli. Se on listattu kymmenen parhaan talouden joukkoon Latinalaisessa Amerikassa ja kolmanneksi Meksikossa bruttokansantuotteella mitattuna. FDi-lehti arvioi vuoden 10 "Tulevaisuuden kaupungit" -kyselyssään Guadalajaran ensimmäiseksi suurten Meksikon kaupunkien joukossa ja nimesi sen olevan toiseksi korkein taloudellinen potentiaali kaikista suurista Pohjois-Amerikan kaupungeista Chicagon jälkeen. Vuonna 2007 FDI valitsi sen Latinalaisen Amerikan parhaaksi yritysystävälliseksi kaupungiksi.
Moody's Investors Service myönsi Moody's Investors Servicelle luokitukset Ba1 (globaali, paikallinen valuutta) ja A1.mx vuonna 2009 (Meksikon kansallinen mittakaava). Kunnan taloudellinen kehitys oli ollut epäjohdonmukaista koko edellisen viiden vuoden ajan, mutta se oli alkanut tasaantua viimeisen kahden vuoden aikana. Guadalajaralla on yksi suurimmista kunnallisista budjeteista Meksikossa, ja sen tulot asukasta kohden (2,265 2016 dollaria) ovat korkeammat kuin Moody'sin arvioiden kaupunkien kansallinen keskiarvo.
Kaupungin talous jakautuu kahteen erilliseen segmenttiin. Kauppa ja matkailu työllistävät suurimman osan ihmisistä, noin 60 prosenttia työvoimasta. Toinen on teollisuus, joka on ollut taloudellisen kasvun moottori ja Guadalajaran kansallisen taloudellisen merkityksen perusta, mutta työllistää alle kolmanneksen väestöstä. Alueen teollisuudenalat valmistavat erilaisia tavaroita, mukaan lukien ruokaa ja juomia, leluja, tekstiilejä, autonosia, sähkölaitteita, lääkkeitä, jalkineita ja huonekaluja. Tekstiilit ja jalkineet ovat olleet kaksi tärkeintä alaa, ja molemmat ovat tällä hetkellä elinvoimaisia ja kasvavat. 60 % tuotetuista tuotteista myydään paikallisille markkinoille ja 40 % viedään, enimmäkseen Yhdysvaltoihin. Tämän seurauksena Guadalajaran taloudellinen omaisuus liittyy erottamattomasti Yhdysvaltoihin sekä investointien lähteenä että sen tuotteiden markkinana.
Elektroniikka- ja tietotekniikkateollisuus on kuitenkin kutsunut kaupunkia "Meksikon Piilaaksoksi". Guadalajara on Meksikon suurin ohjelmistojen, elektroniikan ja digitaalisten komponenttien valmistaja. Guadalajaran tietoliikenne- ja tietokonelaitteiden vienti muodostaa noin viidenneksen Meksikon elektroniikkaviennistä. Kaupungissa ja sen lähiöissä asuu yrityksiä, kuten General Electric, IBM, Intel Corporation, Freescale Semiconductor, Hitachi Ltd., Hewlett-Packard, Siemens, Flextronics, Oracle, TCS, Cognizant Technology Solutions ja Jabil Circuit. Tämä tapahtui, kun Pohjois-Amerikan vapaakauppasopimus (NAFTA) ratifioitiin. Kansainväliset yritykset aloittivat toimintansa Meksikossa, erityisesti Guadalajarassa, kotimaisten tilalle erityisesti tietotekniikan alalla. Yksi tämän seurauksista on se, että suuret monikansalliset yhtiöt vähentävät toimintaansa talouden taantuman aikana.
Guadalajaralla on fDi-lehden mukaan toiseksi suurin taloudellinen potentiaali kaikista suurista Pohjois-Amerikan metropoleista vain Chicagon jälkeen. Guadalajara tunnistettiin "tulevaisuuden kaupungiksi" samassa tutkimuksessa sen nuoren väestön, alhaisen työttömyysasteen ja viimeaikaisten ulkomaisten investointien suuren määrän vuoksi. se tunnistettiin myös Pohjois-Amerikan kolmanneksi yritysystävällisimmäksi kaupungiksi.
Kaupungin on kilpailtava Kiinan kanssa, erityisesti elektroniikka-aloilla, jotka ovat riippuvaisia suuresta volyymista ja halvoista palkoista. Tämän seurauksena se on siirtänyt painopisteensä korkealaatuisiin, keskimääräisiin ja lisäarvopalveluihin, kuten autoteollisuuteen. Guadalajaran perinteinen etu Yhdysvaltojen markkinoiden läheisyydestä auttaa kuitenkin pysymään kilpailukykyisenä. Meksiko oli Latinalaisessa Amerikassa kolmas vuonna 2009 tietotekniikkapalvelujen viennissä Brasilian ja Argentiinan jälkeen. Tällainen palvelu koskee enimmäkseen teknisen avun antamista sähköpostitse ja puhelimitse. Tämän alan ensisijainen ongelma on englanninkielisten korkeakoulututkinnon suorittaneiden pula.
