Los pueblos pigmeos fueron los primeros en asentarse en la región. A medida que avanzaban, las tribus bantúes los suplantaron y asimilaron principalmente.
Los primeros europeos llegaron en el siglo XV. En Gabón, en el siglo XVIII surgió una monarquía de habla myeni conocida como Orungu.
Bartholomew Roberts, un pirata galés conocido como Black Bart, pereció en el mar frente a la costa de Cabo López el 10 de febrero de 1722. Desde 1719 hasta 1722, atacó barcos a lo largo de las costas de América y África Occidental.
En 1875, el aventurero francés Pierre Savorgnan de Brazza dirigió la primera expedición a la región de Gabón-Congo. Estableció Franceville y posteriormente se desempeñó como gobernador colonial. Cuando Francia conquistó formalmente Gabón en 1885, muchas tribus bantúes residían en la región que hoy es Gabón.
Gabón se unió a las cuatro regiones del África Ecuatorial Francesa en 1910, formando una federación que duró hasta 1959. El 17 de agosto de 1960, estas regiones obtuvieron la independencia. Léon M'ba fue el primer presidente de Gabón, elegido en 1961, junto con Omar Bongo Ondimba como vicepresidente.
Tras el ascenso al poder de M'ba, se reprimió la prensa, se prohibieron los mítines políticos, se restringió la libertad de expresión, se expulsó progresivamente del poder a otros partidos políticos y se modificó la Constitución siguiendo las líneas francesas para conferir poder a la Presidencia, que M'ba tomó. Cuando M'ba disolvió la Asamblea Nacional para establecer un gobierno de partido único en enero de 1964, un golpe militar intentó deponerlo y restaurar la democracia parlamentaria. En 24 horas, llegaron paracaidistas franceses para restaurar el poder de M'ba.
A pesar de las manifestaciones masivas y los disturbios, el golpe terminó después de unos días de combate y la oposición fue encarcelada. Hasta el día de hoy, las tropas francesas están estacionadas en Camp de Gaulle, en las afueras de la ciudad de Gabón. Bongo asumió la presidencia cuando M'Ba murió en 1967.
Bongo proclamó Gabón un estado de partido único en marzo de 1968, disolviendo el BDG y fundando el Parti Democratique Gabonais (PDG). Dio la bienvenida a todos los gaboneses a unirse, independientemente de su lealtad política pasada. Bongo usó el PDG como vehículo para ahogar los conflictos regionales y tribales que previamente habían dividido la política gabonesa para crear un movimiento nacional unificado a favor de los objetivos de desarrollo del gobierno. En febrero de 1975, Bongo fue elegido presidente; en abril de 1975, la vicepresidencia fue abolida y reemplazada por el cargo de primer ministro, que no tenía derechos de sucesión automática. Bongo fue reelegido por un período de 7 años como presidente en diciembre de 1979 y noviembre de 1986.
Estudiantes y trabajadores protagonizaron protestas y huelgas violentas a principios de la década de 1990, alimentadas por el descontento económico y el deseo de reforma política. Bongo trabajó con los empleados sector por sector en respuesta a sus quejas, logrando reducciones salariales sustanciales. También dijo que abriría el PDG y celebraría una conferencia política nacional en marzo-abril de 1990 para debatir la futura estructura política de Gabón. A la reunión asistieron el PDG y 74 grupos políticos. El PDG gobernante y sus partidarios se dividieron en dos coaliciones sueltas, el Frente Unido de Asociaciones y Partidos de Oposición, que incluía a la disidente Morena Fundamental y al Partido del Progreso de Gabón.
La conferencia de abril de 1990 respaldó cambios políticos significativos, incluido el establecimiento de un Senado nacional, la descentralización del proceso presupuestario, la libertad de reunión y de prensa, y la eliminación de la necesidad de una visa de salida. Bongo renunció como presidente del PDG en un esfuerzo por liderar la transición del sistema político a una democracia multipartidista y se formó una administración de transición encabezada por un nuevo Primer Ministro, Casimir Oye-Mba. La administración resultante, conocida como Agrupación Socialdemócrata Gabonesa (RSDG), era más pequeña que la anterior y contaba con miembros de varios grupos de oposición en su gabinete. En mayo de 1990, el RSDG elaboró una constitución temporal que incluía una declaración básica de derechos y un poder judicial independiente, pero otorgaba al presidente amplios poderes administrativos. Este documento entró en vigor en marzo de 1991 después de un examen adicional por parte de un comité constitucional y la Asamblea Nacional.
Sin embargo, la oposición al PDG persistió después de la reunión de abril de 1990, y en septiembre de 1990 se descubrieron y frustraron dos intentos de golpe. Elecciones a la Asamblea en casi 30 años en septiembre-octubre de 1990.
Tras la reelección del presidente Omar Bongo con el 51% de los votos en diciembre de 1993, los candidatos de la oposición se negaron a aceptar los resultados. Tras graves disturbios civiles, el gobierno y los grupos de oposición acordaron trabajar para encontrar una solución política. Estas discusiones dieron como resultado los Acuerdos de París, que se firmaron en noviembre de 1994 e incluyeron a muchos líderes de la oposición en un gobierno de unidad nacional. Sin embargo, este arreglo se vino abajo rápidamente, y las elecciones parlamentarias y municipales de 1996 y 1997 sentaron las bases para el regreso a la política partidista. El PDG obtuvo una victoria rotunda en las elecciones parlamentarias, pero en las elecciones municipales de 1997 se eligieron alcaldes de la oposición en muchas ciudades grandes, incluida Libreville.
En diciembre de 1998, el presidente Omar Bongo logró la reelección con una gran mayoría de votos, a pesar de una oposición dividida. A pesar de numerosas supuestas anomalías, varios observadores extranjeros describieron los resultados como representativos, y no hubo disturbios violentos que precedieron a las elecciones de 1993. El PDG y los independientes asociados controlaron la Asamblea Nacional casi en su totalidad después de elecciones parlamentarias pacíficas pero defectuosas en 2001-2002, que fueron boicoteadas por varios partidos menores de oposición y severamente condenadas por fallas administrativas. El presidente Omar Bongo fue reelegido en noviembre de 2005 para un sexto mandato. Fue reelegido cómodamente, aunque los opositores alegan que la elección estuvo plagada de irregularidades. Tras el anuncio de su victoria, hubo algunos incidentes de violencia, pero Gabón mantuvo la calma en general.
En diciembre de 2006 se llevaron a cabo nuevas elecciones para la Asamblea Nacional. La Corte Constitucional revocó muchos escaños que habían sido impugnados debido a irregularidades en las votaciones, pero el PDG retuvo el control de la Asamblea Nacional en la segunda vuelta de las elecciones a principios de 2007.
El presidente Omar Bongo murió de un paro cardíaco el 8 de junio de 2009 en un hospital español en Barcelona, lo que marcó el comienzo de una nueva era en la política gabonesa. Rose Francine Rogombé, presidenta del Senado, fue nombrada presidenta interina el 10 de junio de 2009, de conformidad con la constitución revisada. El 30 de agosto de 2009 se llevaron a cabo las primeras elecciones competitivas en la historia de Gabón sin Omar Bongo como candidato, con 18 candidatos a presidente. Hubo algunas manifestaciones menores en el período previo a las elecciones, pero no hubo interrupciones importantes. Después de una revisión de tres semanas por parte de la Corte Constitucional, el hijo de Omar Bongo, el líder del partido gobernante Ali Bongo Ondimba, fue proclamado oficialmente ganador; su toma de posesión tuvo lugar el 16 de octubre de 2009.
Muchos candidatos de la oposición alegaron fraude electoral, y la primera publicación de los resultados electorales provocó manifestaciones inusualmente violentas en Port-Gentil, la segunda ciudad más grande del país y un bastión de resistencia a la administración del PDG durante mucho tiempo. Los residentes de Port-Gentil corrieron a las calles e incendiaron una serie de negocios y hogares, incluido el consulado francés y una cárcel local. Solo cuatro personas murieron en los disturbios, según cifras oficiales, pero la oposición y los líderes locales dicen que hubo muchas más. Para ayudar a la policía en apuros, se envió a gendarmes y militares a Port-Gentil y se impuso un toque de queda durante más de tres meses.
En junio de 2010 se llevó a cabo una elección parcial legislativa parcial. Por primera vez, participó una coalición de partidos recién formada, la Unión Nacional (ONU). Los desertores del PDG que abandonaron el partido tras la muerte de Omar Bongo constituyen la mayoría de la ONU. El PDG ganó tres de los cinco escaños disputados ferozmente, mientras que la ONU ganó dos; ambas partes reclamaron la victoria.
