Zakynthos ligger på det østlige Ioniske Hav, omkring 20 kilometer (12 miles) vest for den græske (Peloponnes) halvø. Kefalonia er omkring 15 kilometer (9 miles) mod nord. Det er den sydligste af den største gruppe af ioniske øer (ikke medregnet det fjerne Kythira). Zakynthos er omkring 40 kilometer (25 miles) lang og 20 kilometer (12 miles) bred, med et samlet areal på 405.55 km2 (156.58 sq mi). Den har en kystlinje, der strækker sig omkring 123 kilometer (76 miles). Øen har en befolkning på 40,759 mennesker ifølge folketællingen i 2011. Vrachionas, på 758 m, er den højeste top.
Øen Zakynthos er formet som en pilespids, med "spidsen" (Cape Skinari) pegende mod nordvest. Øens vestlige halvdel er et højt plateau, mens den sydvestlige bred primært består af skarpe klipper. Den østlige side er en tæt befolket frugtbar slette med lange sandstrande, opdelt af nogle få isolerede bakker, især Bochali, som har udsigt over byen og Vasilikos-halvøen i nordøst. Halvøerne Vassilikos mod nord og Marathia mod syd omkranser den store og lavvandede havn i Laganas i øens sydøst.
Byen Zakynthos, der har samme navn som præfekturet, fungerer som hovedstad. Den ligger på nordkystens østligste punkt. Bortset fra det officielle navn er det også kendt som Chora (dvs. byen, en almindelig betegnelse i Grækenland, når navnet på selve øen er det samme som navnet på hovedbyen). En færge forbinder havnen i Zakynthos med havnen i Kyllini på fastlandet. En anden båd forbinder landsbyen Agios Nikolaos med den kefaloniske by Argostoli. Marathonisi, Pelouzo og Agios Sostis i Laganas-bugten; Agios Nikolaos, ved navnebroen på det nordlige punkt; og Agios Ioannis nær Porto Vromi på den vestlige kyst er mindre øde øer, der indgår i kommunen og den regionale enhed.
Flora og fauna
Øens tykke vegetation er et resultat af øens moderate middelhavsklima og rigelige vinterregn. Olivenolie, ribs, druer og citrusfrugter er de vigtigste landbrugsprodukter. Zante ribs er en lille lækker kernefri drue endemisk til øen. Laganas-bugten er hjemsted for Middelhavets første nationale marinepark og et godt ynglehabitat for havskildpadder (Caretta caretta). Laganas-bugten var stærkt truet som rede i begyndelsen af 1980'erne, men i høj grad på grund af MEDASSETs grundlægger og præsident Lily Venizelos indsats, blev den reddet. Caretta caretta er en kritisk truet art, der forværres af tilstedeværelsen af liggestole på deres parringssteder og den efterfølgende forurening. Hvert år i begyndelsen af juni tager hunskildpadder til de sydlige strande for at afsætte deres æg på sandet.
Redens inkubationstid er omkring 55 dage, hvorefter unger flygter fra reden og går til havet. Deres overlevelsesrate er meget lav; kun én ud af hver tusinde unge, der kommer i vandet, overlever til modenhed. Hver rede har omkring hundrede til hundrede og tyve æg, hver på størrelse og form som en pingpongbold. Hunskildpadder begynder at lægge æg, når de er mellem tyve og tredive år.
