Nagasaki er hovedstaden og største by i Nagasaki Prefecture på den japanske ø Kyushu. Det var et centrum for portugisisk og hollandsk indflydelse fra det 16. til det 19. århundrede, og Nagasakis kirker og kristne steder er blevet anbefalet til optagelse på UNESCOs verdensarvsliste. Under den første kinesisk-japanske krig og den russisk-japanske krig var en stor kejserlig japansk flådebase placeret i Nagasaki. Dens navn oversættes som "lang kappe."
Under Anden Verdenskrig gjorde de amerikanske atombomber i Hiroshima og Nagasaki Nagasaki til verdens anden og til dato eneste atomangrebne by.
Fra 1. januar 2009 har byen en anslået befolkning på 446,007 mennesker og en befolkningstæthed på 1,100 mennesker per kvadratkilometer. Hele landarealet er på 406.35 km2.