ก่อนที่คลื่นของชาวเป่าตูจะเริ่มอพยพมาจากทางเหนือในช่วงศตวรรษที่ 10 ภูมิภาคของแอฟริกาในปัจจุบันที่รู้จักกันในชื่อมาลาวีมีประชากรนักล่าและรวบรวมพรานค่อนข้างน้อย แม้ว่าชนชาติเป่าโถส่วนใหญ่ย้ายไปทางใต้ แต่บางคนก็อยู่และตั้งกลุ่มชาติพันธุ์ตามบรรพบุรุษที่มีร่วมกัน ชนเผ่าต่าง ๆ ก่อตั้งอาณาจักรมาราวีราว ๆ ค.ศ. 1500 ซึ่งทอดยาวจากทางเหนือของตอนนี้คือ Nkhotakota ไปจนถึงแม่น้ำ Zambezi และจากทะเลสาบมาลาวีไปจนถึงแม่น้ำ Luangwa ในแซมเบีย
ชนเผ่าท้องถิ่นเริ่มพบปะ รับมือ และสร้างพันธมิตรกับพ่อค้าชาวโปรตุเกสและบุคลากรทางการทหารไม่นานหลังปี 1600 เมื่อภูมิภาคนี้รวมกันเป็นหนึ่งเดียวภายใต้กษัตริย์องค์เดียว อย่างไรก็ตาม ภายในปี 1700 จักรวรรดิได้สลายตัวเป็นภูมิภาคที่ปกครองโดยกลุ่มชาติพันธุ์ต่างๆ ในช่วงกลางปี ค.ศ. 1800 การจราจรของทาสชาวสวาฮิลี-อาหรับพุ่งสูงสุด โดยมีคนประมาณ 20,000 คนที่เป็นทาสและถูกส่งตัวทุกปีจาก Nkhotakota ไปยังเมือง Kilwa ซึ่งพวกเขาถูกขายไป
ในปี 1859 มิชชันนารีและนักสำรวจ David Livingstone มาถึงทะเลสาบมาลาวี (จากนั้นคือทะเลสาบ Nyasa) และค้นพบที่ราบสูงไชร์ทางตอนใต้ของทะเลสาบซึ่งเป็นสถานที่ที่เหมาะสำหรับการล่าอาณานิคมของยุโรป ภารกิจแองกลิกันและเพรสไบทีเรียนหลายแห่งถูกจัดตั้งขึ้นในพื้นที่อันเป็นผลมาจากการมาเยือนของลิฟวิงสโตนในช่วงทศวรรษ 1860 และ 1870 บริษัท African Lakes Company Limited ก่อตั้งขึ้นในปี 1878 เพื่อสร้างข้อกังวลด้านการค้าและการขนส่งโดยทำงานอย่างใกล้ชิดกับภารกิจดังกล่าว ตลอดจนภารกิจเล็กๆ และการค้าขาย การตั้งถิ่นฐานก่อตั้งขึ้นที่แบลนไทร์ในปี พ.ศ. 1876 โดยมีกงสุลอังกฤษอาศัยอยู่ที่นั่นในปี พ.ศ. 1883 เนื่องจากรัฐบาลโปรตุเกสสนใจในภูมิภาคนี้ด้วย รัฐบาลอังกฤษจึงส่งแฮร์รี่ จอห์นสตันเป็นกงสุลอังกฤษพร้อมคำสั่งให้เจรจาสนธิสัญญากับหน่วยงานท้องถิ่นนอกโปรตุเกส อำนาจเพื่อหลีกเลี่ยงการผนวกโปรตุเกส
เขตอารักขาแอฟริกากลางของอังกฤษก่อตั้งขึ้นในปี 1889 เหนือที่ราบสูงไชร์ และขยายในปี 1891 เพื่อให้ครอบคลุมมาลาวีทั้งหมดในปัจจุบัน รัฐในอารักขาถูกเปลี่ยนชื่อเป็น Nyasaland ในปี 1907 และยังคงเป็นชื่อนั้นสำหรับรัฐบาลที่เหลือของอังกฤษ การปกครองอาณานิคมของ Nyasaland ก่อตั้งขึ้นในปี 1891 และเป็นตัวอย่างคลาสสิกของสิ่งที่มักเรียกกันว่า "Thin White Line" ของอำนาจอาณานิคมในแอฟริกา ผู้บริหารได้รับงบประมาณรายปี 10,000 ปอนด์ (ตามมูลค่าตามมูลค่าที่ระบุ) ซึ่งเพียงพอที่จะจ้างพลเมืองยุโรป 1891 คน ผู้บัญชาการทหาร 85 คน ปัญจาบซิกข์เจ็ดสิบคน และพนักงานเฝ้าประตูเมืองแซนซิบาร์ 94,000 คน บุคลากรไม่กี่คนเหล่านี้ถูกคาดหวังให้จัดการและควบคุมพื้นที่ 2016 ตารางกิโลเมตรที่มีประชากรหนึ่งถึงสองล้านคน
การประชุม Nyasaland African Congress (NAC) ก่อตั้งขึ้นในปี 1944 โดยชาวแอฟริกันของ Nyasaland เพื่อเป็นตัวแทนความกังวลในท้องถิ่นที่มีต่อฝ่ายบริหารของอังกฤษ ด้วยเหตุผลทางการเมืองล้วนๆ บริเตนเข้าร่วม Nyasaland กับ Northern และ Southern Rhodesia ในสหพันธ์โรดีเซียและ Nyasaland ซึ่งมักเป็นที่รู้จักในชื่อสหพันธ์แอฟริกากลาง (CAF) ในปี 1953 แม้ว่าสหพันธ์จะอยู่ภายใต้การปกครองแบบกึ่งอิสระ แต่ความสัมพันธ์ดังกล่าวได้จุดประกายการต่อต้านชาตินิยมในแอฟริกา และ กปปส.ได้รับการสนับสนุนจากประชาชน ดร. เฮสติงส์ บันดา แพทย์ชาวยุโรปที่ได้รับการฝึกฝนในกานา ผู้ถูกชักชวนให้เดินทางกลับ Nyasaland ในปี 1958 เพื่อช่วยขบวนการชาตินิยม เป็นศัตรูที่มีอำนาจของ CAF ก่อนที่จะถูกคุมขังโดยเจ้าหน้าที่อาณานิคมในปี 1959 บันดาได้รับเลือกให้เป็นประธานาธิบดีของ NAC และพยายามระดมความกระตือรือร้นในลัทธิชาตินิยม ในปีพ.ศ. 1960 เขาได้รับอิสรภาพและได้รับเชิญให้ช่วยร่างรัฐธรรมนูญฉบับใหม่สำหรับ Nyasaland ซึ่งรวมถึงบทบัญญัติที่ให้ชาวแอฟริกันเป็นส่วนใหญ่ในสภานิติบัญญัติของอาณานิคม
ในการเลือกตั้งสภานิติบัญญัติในปี 1961 พรรคคองเกรสมาลาวีของบันดา (MCP) ชนะเสียงข้างมาก และเขาเป็นนายกรัฐมนตรีในปี 1963 สหพันธ์ถูกยุบในปี 1963 และญาซาแลนด์ประกาศอิสรภาพจากการควบคุมของอังกฤษเมื่อวันที่ 6 กรกฎาคม 1964 เปลี่ยนชื่อตนเองเป็นมาลาวี . มาลาวีกลายเป็นสาธารณรัฐภายใต้รัฐธรรมนูญฉบับใหม่ โดยมีบันดาเป็นประธานาธิบดีคนแรก ปัจจุบันมาลาวีเป็นรัฐพรรคเดียวอย่างเป็นทางการ โดย MCP เป็นพรรคการเมืองที่ถูกต้องตามกฎหมายเพียงพรรคเดียว บันดาได้รับเลือกเป็นประธานาธิบดีตลอดชีวิตในปี พ.ศ. 1971 เป็นเวลาเกือบ 30 ปีที่บันดาปกครองระบบเผด็จการที่เข้มงวดซึ่งทำให้มาลาวีปราศจากความขัดแย้งรุนแรง ในการพลัดถิ่น กลุ่มต่อต้านเช่นขบวนการเสรีภาพมาลาวีของ Orton Chirwa และสันนิบาตสังคมนิยมแห่งมาลาวีได้ถูกสร้างขึ้น
เศรษฐกิจของมาลาวีภายใต้ตำแหน่งประธานาธิบดีของบันดามักถูกขนานนามว่าเป็นตัวอย่างของการที่ประเทศที่ยากจน ไม่มีทางออกสู่ทะเล มีประชากรหนาแน่นและยากจนอาจทำให้การเกษตรและอุตสาหกรรมเติบโตได้อย่างไร
บันดาสร้างอาณาจักรการค้าในขณะที่อยู่ในอำนาจ โดยใช้การควบคุมของประเทศเพื่อสร้างจีดีพีของประเทศหนึ่งในสาม และใช้ 10% ของประชากรที่ได้รับค่าจ้างของประเทศ บันดาลงทุนรายได้ทั้งหมดของเขาเพื่อการพัฒนาของมาลาวี ซึ่งเป็นสัญลักษณ์ของการสร้างสถาบันคามูซู ซึ่งเป็นโรงเรียนประจำที่มีชื่อเสียง (อีตันแห่งแอฟริกา) แรงจูงใจในการมอบโรงเรียนแห่งนี้ให้กับมาลาวีในคำพูดของบันดาเองว่า “ฉันไม่ต้องการให้ลูกชายและลูกสาวของฉันต้องทำสิ่งที่ฉันต้องทำ – ออกจากบ้านและครอบครัวของพวกเขาและเดินทางจากมาลาวีเพื่อรับการศึกษา ”
ในปี พ.ศ. 1993 ภายใต้ความต้องการเสรีภาพทางการเมืองมากขึ้น บันดายินยอมให้มีการลงประชามติซึ่งประชาชนได้ลงคะแนนเสียงสนับสนุนระบอบประชาธิปไตยแบบหลายพรรค สภาประธานาธิบดีก่อตั้งขึ้นเมื่อปลายปี 1993 ตำแหน่งประธานชีวิตถูกยกเลิก และมีการตรารัฐธรรมนูญใหม่ ซึ่งเป็นการยุติการครองราชย์ของ MCP ในปี 1994 มาลาวีมีการเลือกตั้งแบบหลายพรรคเป็นครั้งแรก และบันดาพ่ายแพ้โดย Bakili Muluzi (อดีตเลขาธิการ MCP และอดีตรัฐมนตรี Banda Cabinet) Muluzi ได้รับเลือกตั้งเป็นประธานาธิบดีอีกครั้งในปี 1999 และดำรงตำแหน่งจนถึงปี 2004 เมื่อ Dr. Bingu wa Mutharika ได้รับเลือก แม้ว่าบรรยากาศทางการเมืองจะมีลักษณะที่ "ยาก" แต่ระบบหลายพรรคของมาลาวียังคงใช้อยู่จนถึงปี 2009 ในเดือนพฤษภาคม 2009 มาลาวีดำเนินการเลือกตั้งประธานาธิบดีและฝ่ายนิติบัญญัติหลายพรรคเป็นครั้งที่สี่ โดยประธานาธิบดีมูธาริกาได้รับเลือกใหม่ท่ามกลางข้อกล่าวหาเรื่องการฉ้อโกงการเลือกตั้งจาก คู่ต่อสู้ของเขา
บางคนมองว่าประธานาธิบดีมุทาริกาเป็นเผด็จการและดูถูกสิทธิมนุษยชนมากกว่า และการชุมนุมปะทุขึ้นในเดือนกรกฎาคม 2011 เนื่องจากค่าครองชีพที่เพิ่มสูงขึ้น ความสัมพันธ์ระหว่างประเทศตกต่ำ การบริหารงานที่ไม่ดี และการขาดแคลนทุนสำรองเงินตราต่างประเทศ การเดินขบวนดังกล่าวส่งผลให้มีผู้เสียชีวิต 18 ราย และมีผู้บาดเจ็บอีกอย่างน้อย 44 ราย มูธาริกาถึงแก่อสัญกรรมหลังจากหัวใจวายในเดือนเมษายน 2012 และอดีตรองประธานาธิบดีจอยซ์ บันดากลายเป็นประธานาธิบดี
Joyce Banda จบที่สามในการเลือกตั้งปี 2014 และประสบความสำเร็จโดย Arthur Peter Mutharika น้องชายของประธานาธิบดีที่ได้รับการเลือกตั้งคนที่สามของมาลาวี