Люди Сан были коренными жителями того, что сейчас является Лесото. Образцы их наскального искусства можно увидеть в горах этого района.
В 1822 году король Мошошу I основал нынешнее Лесото, тогда известное как Басутоленд, как единое государство. Мошошу, сын Мохачане, второстепенного вождя линии бакотели, основал свой собственный клан и стал известен примерно в 1804 году. Между 1821 и 1823 годами он и его последователи проживали на горе Бута-Буте, присоединившись к старым врагам в борьбе против Лифакане, что было связано с правлением Шака Зулу с 1818 по 1828 год.
После захвата Капской колонии британцами у союзных Франции голландцев в 1795 году последующее развитие государства было основано на спорах между британскими и голландскими колонистами, бежавшими из Капской колонии и позже связанными с суверенитетом Оранжевой реки и последующим Оранжевым свободным государством. Между 1837 и 1855 годами Мошошу I приветствовал миссионеров из Парижского евангелического миссионерского общества, Томаса Арбуссе, Эжена Казалиса и Константа Госселина, в Мориху, где они установили орфографию и печатали произведения на языке сесото. Казалис, который работал переводчиком и консультировал по вопросам внешней политики, помогал в установлении дипломатических каналов и приобретении оружия для использования против вторгшихся европейцев и народа грикуа.
Начиная с мая – июня 1838 года трекбуры из Капской колонии прибыли на западные границы Басутоленда и потребовали прав на землю, начиная с Яна де Виннаара, который обосновался в районе Матлакенг. По мере того, как в регион двигались дополнительные буры, они пытались колонизировать земли между двумя реками, даже к северу от Каледон, говоря, что народ сото покинул их. После этого Мошошу подписал контракт с британским губернатором Капской колонии сэром Джорджем Томасом Нейпиром, который аннексировал суверенитет над Оранжевой рекой, где проживало много буров. В 1848 году эти разъяренные буры потерпели поражение в коротком конфликте. Британские силы были разбиты армией басуто в Колоньяме в 1851 году, что вызвало унизительный конфликт для британцев. Отразив еще одно британское нападение в 1852 году, Мошошу обратился к британскому командующему, что привело к дипломатическому урегулированию, прежде чем победить Батлокоа в 1853 году.
Британцы ушли из этого района в 1854 году, а в 1858 году Мошошу провел серию сражений против буров в войне между Свободным государством и басуто, потеряв большую часть западных низменностей. Предыдущий конфликт завершился в 1867 году, когда Мошошу подал петицию королеве Виктории, которая согласилась установить Басутоленд под британским протекторатом в 1868 году. Королевство Мошошу уменьшилось вдвое от прежнего размера за счет сдачи западных провинций.
После уступки в 1869 году британцы сначала перенесли обязанности из столицы Мошошу в Таба Босиу в полицейский лагерь на северо-западной границе, Масеру, до тех пор, пока Басутоленд не перешел под управление Капской колонии в 1871 году. Мошошу умер 11 марта 1870 года, принеся с собой традиционные период к концу и вступая в колониальную эру. Он был похоронен в Таба Босиу. В период с 1871 по 1884 год, в первые годы британской администрации, с Басутолендом обращались так же, как и с другими территориями, которые были насильственно приобретены, к большому неудовольствию басуто. Это привело к Оружейной войне 1881 года. Статус Басутоленда как протектората был восстановлен в 1884 году, а Масеру был восстановлен в качестве его столицы, хотя он оставался под прямым контролем губернатора, несмотря на то, что эффективная внутренняя власть принадлежала традиционным вождям.
Басутоленд получил независимость от Великобритании в 1966 году и стал Королевством Лесото.
Правящая Национальная партия басуто (BNP) проиграла первые всеобщие выборы после обретения независимости в январе 1970 года, получив 23 места против 36 у Партии Конгресса Басуто. Премьер-министр Леабуа Джонатан отказался передать власть Партии Конгресса басуто (BCP), объявив себя Тона Холо (сесото означает «премьер-министр») и заключение в тюрьму руководства БКП.
BCP подняла восстание и впоследствии прошла обучение в Ливии для своей Освободительной армии Лесото (LLA), выдавая себя за войска Народно-освободительной армии Азании (APLA) Панафриканского конгресса (PAC). LLA, насчитывающая 178 человек, была спасена со своей базы в Танзании благодаря финансовой помощи чиновника маоистского ПАК в 1978 году после того, как фракция Сибеко ПАК лишила его оружия и припасов, но они начали партизанскую кампанию, имея лишь горстку устаревшего огнестрельного оружия. . После того, как основная армия была уничтожена на севере Лесото, повстанцы проводили периодические, но в целом безрезультатные атаки. Когда глава BCP Нцу Мохеле переехал в Преторию, кампания сильно пострадала. В начале 1980-х годов администрация Леабуа Джонатана запугивала и нападала на многих басуто, сочувствовавших изгнанной BCP. Семья Бенджамина Масило подверглась нападению в сентябре 1981 года. Эдгар Махломола Мотуба был похищен и убит через несколько дней.
С 1966 по январь 1970 года страной управляла БНП. За этим последовала администрация де-факто, возглавляемая доктором Леабуа Джонатаном до 1986 года, когда она была свергнута в результате военного переворота. Король Мошошу II, который ранее был церемониальным королем, получил исполнительные полномочия от пришедшего к власти Переходного военного совета. Однако король был изгнан в 1987 году после представления шестистраничного меморандума, в котором излагалось его видение конституции Лесото, которая предоставила бы ему более широкие исполнительные полномочия, если бы военное правительство согласилось. Его сын был коронован королем Летси III.
Генерал-майор Джастин Метсинг Леханья, глава военной хунты, был свергнут в 1991 году и заменен генерал-майором Элиасом Физоаной Рамама, который в 1993 году передал контроль демократически избранной администрации БКП. Мошошу II вернулся из ссылки в качестве обычного гражданина в 1992 году. После восстановления демократического правления король Летсие III безуспешно пытался убедить администрацию БКП восстановить его отца (Мошошу II) на посту главы государства.
После того, как администрации БКП не удалось восстановить его отца, Мошошу II, согласно конституции Лесото, Летси III совершил при поддержке военных переворот, в результате которого в августе 1994 года было свергнуто правительство БКП. Новая администрация не была полностью признана международным сообществом. Страны-члены Южноафриканского сообщества развития (SADC) ведут переговоры о восстановлении правительства BCP. Одно из требований, предложенных Летси III, заключалось в том, чтобы его отец был вновь назначен главой государства. После затяжных переговоров правительство БКП было восстановлено, и Летси III отрекся от престола в пользу своего отца в 1995 году, но снова взошел на трон, когда Мошошу II умер в возрасте пятидесяти семи лет в предполагаемом дорожно-транспортном происшествии, когда его машина рухнула с горы. дороге рано утром 15 января 1996 года. По данным властей, Мошошу уехал в час ночи, чтобы повидаться со своим скотом в Матсиенге, и возвращался в Масеру через горы Малути, когда его машина слетела с дороги.
Правящая BCP раскололась в 1997 году из-за разногласий в руководстве. Премьер-министр Нцу Мохеле учредил новую партию, Конгресс Лесото за демократию (LCD), и получил поддержку большинства парламентариев, что позволило ему сформировать новую администрацию. Пакалита Мосисили занял пост лидера партии после смерти Мохеле, и ЖК выиграла всеобщие выборы в 1998 году. Несмотря на то, что местные и международные наблюдатели, а также специальная комиссия, созданная САДК, а также специальная комиссия, политические партии оспаривали результаты.
Протесты оппозиции в стране нарастали, кульминацией которых стал мирный митинг у королевского дворца в августе 1998 года. Точные подробности того, что произошло дальше, горячо обсуждаются как в Лесото, так и в Южной Африке. Хотя солдат Сил обороны Ботсваны приветствовали, напряженность в отношениях с персоналом Национальных сил обороны ЮАР была высокой, что привело к насилию. Спорадические беспорядки участились, когда южноафриканские солдаты подняли южноафриканский флаг над Королевским дворцом. К моменту ухода войск САДК в мае 1999 года большая часть города Масеру лежала в руинах, а столицы южных провинций Мафетенг и Мохале-Хук потеряли более трети своей коммерческой недвижимости. Несколько южноафриканцев и басуто также были убиты в ходе конфликта.
В декабре 1998 г. был создан Временный политический орган (ВПА) с задачей оценки избирательной системы страны. Чтобы гарантировать представительство оппозиции в Национальной ассамблее, ИПА разработала пропорциональную избирательную систему. Новый метод сохранил нынешние 80 избранных членов Ассамблеи, но добавил 40 пропорционально заполненных мест. В мае 2002 года по этой новой системе были проведены выборы, и ЖК снова победила, набрав 54 процента голосов. Однако впервые оппозиционные политические партии получили значительное количество мест, и в Лесото прошли первые мирные выборы, несмотря на незначительные аномалии и угрозы насилия со стороны генерал-майора Лехани. Все 40 пропорциональных мест в настоящее время принадлежат девяти оппозиционным партиям, причем наибольшая доля приходится на БНП (21 место). ЖК контролирует 79 из 80 мест по округам. Несмотря на то, что избранные ею депутаты входят в состав Национальной ассамблеи, BNP подавала многочисленные юридические жалобы на выборы, включая пересчет голосов, но ни одна из них не увенчалась успехом.
30 августа 2014 г. произошла попытка военного переворота, в результате которой действующий премьер-министр на короткое время бежал в Южную Африку.