Devido à instabilidade política e deficiências em lidar com suas colônias, particularmente Indochina e Argélia, a Quarta República Francesa caiu em 1958. O povo francês apoiou o estabelecimento de uma Quinta República, e o presidente francês Charles de Gaulle deixou claro em 8 de agosto de 1958 , que as colônias da França teriam que escolher entre maior autonomia em uma nova Comunidade Francesa ou independência instantânea em uma votação em 28 de setembro de 1958. As outras colônias escolheram a primeira, mas a Guiné votou decisivamente pela independência, liderada por Ahmed Sékou Touré, cujo O Partido da Guiné (PDG) havia conquistado 56 dos 60 assentos nas eleições territoriais de 1957. Os franceses logo partiram e a Guiné declarou-se uma república soberana e independente em 2 de outubro de 1958, com Sékou Touré como presidente.
A Guiné aliou-se rapidamente à União Soviética após a saída da França e abraçou as políticas comunistas. A Guiné, por outro lado, inclinou-se para uma forma chinesa de socialismo, e a parceria durou pouco. Apesar disso, nações capitalistas como os Estados Unidos continuaram a fornecer assistência e investimentos ao país. Até a relação com a França melhorou; o comércio cresceu após a eleição de Valéry Giscard d'Estaing como presidente francês, e as duas nações trocaram visitas oficiais.
Touré proclamou o PDG como o único partido legítimo em 1960. O governo e o PDG se fundiram nos 24 anos seguintes. Touré foi incontestado por quatro mandatos de sete anos como presidente, e os eleitores receberam uma única lista de candidatos do PDG para a Assembleia Nacional a cada cinco anos. Touré logo se tornou um líder polarizador, defendendo um socialismo africano híbrido em casa e pan-africanismo no exterior, e seu governo tornou-se intolerante às críticas, aprisionando centenas e sufocando a imprensa.
Durante este período, o governo guineense nacionalizou o território, depôs os líderes tradicionais e nomeados pelos franceses e cortou as relações com o governo e as empresas francesas. A situação econômica da Guiné tornou-se tão incerta quanto sua posição diplomática, vacilando entre o apoio à União Soviética e (no final da década de 1970) o apoio aos Estados Unidos. O governo de Touré atacou adversários reais e imaginários, forçando milhares de opositores políticos ao exílio, alegando esquemas e conspirações contra ele em casa e no exterior.
Em 1970, tropas expatriadas da oposição guineense ajudaram soldados portugueses da vizinha Guiné Portuguesa na Operação Mar Verde, uma incursão na Guiné. Os militares portugueses tentaram assassinar ou prender Sekou Toure por seu apoio ao PAIGC, um grupo guerrilheiro que opera na Guiné Portuguesa, entre outras coisas. As tropas portuguesas retiraram-se depois de cumprirem a maioria dos seus objetivos após muitos dias de intenso combate. A frequência de prisões e execuções internas aumentou durante o reinado de Sékou Touré.
Um monumento comemorativo do triunfo militar contra o ataque português em 1970. O único objetivo que o ataque português não conseguiu foi a captura de Ahmed Sékou Touré.
Sékou Touré morreu em 26 de março de 1984, nos Estados Unidos, após uma cirurgia cardíaca, e foi sucedido pelo primeiro-ministro Louis Lansana Beavogui, que serviria como presidente temporário até que novas eleições pudessem ser realizadas.
Em 3 de abril de 1984, o PDG foi definido para escolher um novo líder. Esse indivíduo teria sido o único candidato a presidente sob a constituição. Os coronéis Lansana Conté e Diarra Traoré, no entanto, assumiram o controle em um golpe sem derramamento de sangue apenas algumas horas antes da conferência. Traoré foi primeiro-ministro até dezembro, quando Conté assumiu a presidência.
Conté rapidamente condenou o histórico de direitos humanos do regime anterior, libertou 250 presos políticos e instou outras 200,000 pessoas a retornar do exílio. Ele também deixou claro que estava abandonando o socialismo, embora isso não fizesse nada para aliviar a pobreza, e a nação não mostrava sinais de progresso em direção à democracia.
Conté declarou a restauração do governo civil em 1992, com eleições presidenciais em 1993 e eleições parlamentares em 1995. (nas quais seu partido – o Partido da Unidade e do Progresso – conquistou 71 dos 114 assentos). declarada devoção à democracia. Alpha Condé, o líder da oposição, foi preso em setembro de 2001 por ameaçar a segurança nacional, mas foi libertado oito meses depois. Depois disso, ele foi para o exílio na França.
Conté planejou e venceu um referendo para estender o mandato presidencial em 2001, e iniciou seu terceiro mandato em 2003, quando a oposição boicotou as eleições. Conté escapou de uma suposta tentativa de assassinato em janeiro de 2005 enquanto fazia uma rara aparição pública em Conacri, capital da Guiné. Seus detratores o chamavam de “tirano cansado” cuja morte era inevitável, enquanto seus partidários achavam que ele estava vencendo a guerra contra os dissidentes. A Guiné continua a enfrentar desafios significativos e, de acordo com a Foreign Policy, está à beira de se tornar um estado falido.
Quando os insurgentes cruzaram as fronteiras com a Libéria e Serra Leoa em 2000, a Guiné se envolveu na instabilidade que há muito atormentava o resto da África Ocidental, e parecia por um tempo que a nação estava à beira de uma guerra civil. Conté afirmou que os líderes vizinhos tinham inveja das riquezas naturais da Guiné, mas essas alegações foram rejeitadas com veemência. A Guiné concordou com acordos com seus vizinhos para combater os rebeldes em 2003. Os protestos contra o governo eclodiram em 2007, culminando com a nomeação de um novo primeiro-ministro.