Os microônibus Toca-toca são usados para o transporte urbano em Bissau. Táxis regulares também estão disponíveis. Há sept-lugares (Peugeots de sete lugares) e candongas (grandes veículos comerciais com capacidade para dez a vinte pessoas) para o transporte intermunicipal. Prefira sept-place ou, no mínimo, assentos na primeira fila. Os táxis também podem ser alugados para ir a outras cidades.
O principal terminal rodoviário “paragem” de Bissau localiza-se na Estrada do Aeroporto, atrás do BCEAO (Banco Central dos Estados de África Ocidental). Se você for para Biombo ou Prabis, precisará trocar de ônibus na Estrada de Bor. Não há horários de partida definidos; os veículos saem quando estão cheios. Os carros enchem mais rápido pela manhã, já que a maioria dos moradores se desloca cedo (7h). Pode ser difícil conseguir transporte no final da tarde e à noite.
Para chegar às ilhas, há duas opções: canoas (pirogas) baratas, mas arriscadas, partindo de Porto Pidjiguiti ou Porto de Bandim, ou barcos caros e contemporâneos pertencentes a pousadas de pesca francesas nas ilhas Bijagós. Em 2007, iniciou-se um serviço de ferry entre Bissau e Bubaque, com partida na sexta-feira e regresso no domingo. Os horários estão sujeitos às marés, portanto, verifique com antecedência.
A Guiné-Bissau é uma nação excelente para o ciclismo, pois é extremamente plana e dificilmente há pouco tráfego nas estradas fora de Bissau. As bicicletas podem ser compradas no país, e provavelmente (como no resto do mundo) são fabricadas na China. Como sempre, excelente custo-benefício.