A causa dell'instabilità politica e delle carenze nel trattare con le sue colonie, in particolare Indocina e Algeria, la Quarta Repubblica francese cadde nel 1958. Il popolo francese sostenne l'istituzione di una Quinta Repubblica e il presidente francese Charles de Gaulle lo dichiarò chiaramente l'8 agosto 1958 , che le colonie francesi avrebbero dovuto scegliere tra una maggiore autonomia in una nuova comunità francese o l'indipendenza istantanea con una votazione del 28 settembre 1958. Le altre colonie scelsero la prima, ma la Guinea votò decisamente per l'indipendenza, guidata da Ahmed Sékou Touré, il cui democratico Il Partito della Guinea (PDG) aveva vinto 56 seggi su 60 alle elezioni territoriali nel 1957. I francesi se ne andarono presto e la Guinea si dichiarò repubblica sovrana e indipendente il 2 ottobre 1958, con Sékou Touré come presidente.
La Guinea si alleò rapidamente con l'Unione Sovietica dopo la partenza della Francia e abbracciò le politiche comuniste. La Guinea, d'altra parte, tendeva a una forma di socialismo cinese e la partnership ebbe vita breve. Nonostante ciò, le nazioni capitaliste come gli Stati Uniti hanno continuato a fornire assistenza e investimenti al paese. Anche i rapporti con la Francia sono migliorati; il commercio crebbe in seguito all'elezione di Valéry Giscard d'Estaing a presidente francese e le due nazioni si scambiarono visite ufficiali.
Touré ha proclamato il PDG come l'unico partito legittimo nel 1960. Il governo e il PDG si sono fusi per i successivi 24 anni. Touré è stato incontrastato per quattro mandati di sette anni come presidente e agli elettori è stata fornita un'unica lista di candidati PDG per l'Assemblea nazionale ogni cinque anni. Touré divenne presto un leader polarizzante, sostenendo un socialismo africano ibrido in patria e un panafricanismo all'estero, e la sua amministrazione divenne intollerante alle critiche, imprigionando centinaia di persone e soffocando la stampa.
Durante questo periodo, il governo guineano nazionalizzò il territorio, depose i leader tradizionali e nominati dalla Francia e interruppe le relazioni con il governo e le imprese francesi. La condizione economica della Guinea divenne incerta quanto la sua posizione diplomatica, oscillando tra il sostegno all'Unione Sovietica e (alla fine degli anni '1970) il sostegno agli Stati Uniti. Il governo di Touré ha attaccato oppositori reali e immaginari, costringendo migliaia di oppositori politici all'esilio, accusando schemi e cospirazioni contro di lui in patria e all'estero.
Nel 1970, le truppe dell'opposizione guineana espatriate aiutarono i soldati portoghesi dalla vicina Guinea portoghese nell'operazione Green Sea, un'incursione in Guinea. L'esercito portoghese ha cercato di uccidere o arrestare Sekou Toure per il suo sostegno al PAIGC, un gruppo di guerriglia che opera nella Guinea portoghese, tra le altre cose. Le truppe portoghesi si ritirarono dopo aver raggiunto la maggior parte dei loro obiettivi dopo molti giorni di intensi combattimenti. La frequenza degli arresti interni e delle esecuzioni è aumentata durante il regno di Sékou Touré.
Un monumento che commemora il trionfo militare contro l'attacco portoghese nel 1970. L'unico obiettivo che l'assalto portoghese non è riuscito a raggiungere è stata la cattura di Ahmed Sékou Touré.
Sékou Touré morì il 26 marzo 1984 negli Stati Uniti a seguito di un intervento chirurgico al cuore, e gli successe il primo ministro Louis Lansana Beavogui, che doveva servire come presidente temporaneo fino a quando non si sarebbero potute tenere nuove elezioni.
Il 3 aprile 1984, il PDG doveva scegliere un nuovo leader. Quell'individuo sarebbe stato l'unico contendente alla presidenza secondo la costituzione. I colonnelli Lansana Conté e Diarra Traoré, tuttavia, presero il controllo con un colpo di stato incruento solo poche ore prima della conferenza. Traoré è stato primo ministro fino a dicembre, quando Conté ha assunto la presidenza.
Conté ha rapidamente condannato la situazione dei diritti umani del precedente regime, ha liberato 250 prigionieri politici e ha esortato altre 200,000 persone a tornare dall'esilio. Ha anche chiarito che stava abbandonando il socialismo, anche se questo non ha fatto nulla per alleviare la povertà e la nazione non ha mostrato segni di progresso verso la democrazia.
Conté ha dichiarato la restaurazione del governo civile nel 1992, con le elezioni presidenziali nel 1993 e le elezioni parlamentari nel 1995. (in cui il suo partito - il Partito dell'Unità e del Progresso - ha vinto 71 seggi su 114). La presa del potere di Conté è rimasta forte nonostante il suo dichiarata devozione alla democrazia. Alpha Condé, il leader dell'opposizione, è stato incarcerato nel settembre 2001 per aver minacciato la sicurezza nazionale, ma è stato rilasciato otto mesi dopo. In seguito andò in esilio in Francia.
Conté ha pianificato e vinto un referendum per prolungare il mandato presidenziale nel 2001, e ha iniziato il suo terzo mandato nel 2003 quando l'opposizione ha boicottato le urne. Conté è sfuggita a un sospetto tentativo di omicidio nel gennaio 2005 mentre faceva una rara apparizione pubblica a Conakry, la capitale della Guinea. I suoi detrattori lo chiamavano un "tiranno stanco" la cui scomparsa era inevitabile, mentre i suoi sostenitori pensavano che stesse vincendo la guerra contro i dissidenti. La Guinea continua ad affrontare sfide significative e, secondo Foreign Policy, è sul punto di diventare uno stato fallito.
Quando gli insorti hanno attraversato i confini con la Liberia e la Sierra Leone nel 2000, la Guinea è stata coinvolta nell'instabilità che aveva afflitto a lungo il resto dell'Africa occidentale e per un po' è sembrato che la nazione fosse sull'orlo di una guerra civile. Conté ha affermato che i leader vicini erano invidiosi delle ricchezze naturali della Guinea, ma queste accuse sono state respinte con veemenza. La Guinea ha concordato accordi con i suoi vicini per combattere i ribelli nel 2003. Le proteste contro l'amministrazione sono scoppiate nel 2007, culminate nella nomina di un nuovo primo ministro.
