Gospodarstvo Mostara uglavnom se oslanja na aluminijsku i metalnu industriju, bankarstvo i telekomunikacije. Neke od vodećih tvrtki u zemlji imaju sjedište u gradu.
Mostar je, uz Sarajevo, glavno financijsko središte u Bosni i Hercegovini, sa sjedištem dvije od tri najveće banke u zemlji. Bosna i Hercegovina ima tri nacionalna poduzeća za električne, poštanske i telekomunikacijske usluge, od kojih je svaka u Mostaru (elektrouslužna korporacija 'Elektroprivreda HZHB', poštansko poduzeće Hrvatska Pota Mostar i HT Mostar, treća najveća telekomunikacijska tvrtka u zemlji). Ova tri poduzeća (uz banke i ljevaonicu aluminija) čine značajan udio u ukupnoj gospodarskoj aktivnosti grada. Privatni sektor je u posljednjih nekoliko godina doživio značajnu ekspanziju u malom i srednjem poduzetništvu, što je pridonijelo povoljnom poslovnom okruženju.
S obzirom na prisutnost tri brane na području grada Mostara, grad ima čvrste temelje za buduće industrijsko širenje. U tijeku je i inicijativa za potencijalno korištenje energije vjetra i izgradnju vjetrenjača.
Mostar je ovisio o drugim značajnim poduzećima koja su bila zatvorena, uništena ili smanjena prije rata u Bosni 1992-1995. Među njima su bili SOKO (tvornica vojnih zrakoplova), Fabrika duhana Mostar (duhanski biznis), Hepok (prehrambena industrija). Mostarski BDP po glavi stanovnika 1981. bio je 103 posto jugoslavenskog prosjeka.
Aluminij je jedino poduzeće s područja bivše Jugoslavije koje još uvijek radi. Aluminij je jedna od najjačih tvrtki u zemlji, s nizom stranih partnera. Godišnja proizvodnja tvrtke rapidno raste, a ona surađuje sa značajnim svjetskim tvrtkama kao što su Daimler Chrysler i Fiat. Aluminij je jedan od najmoćnijih poduzeća u gradu, regiji i državi. S obzirom na sadašnje industrijske kapacitete, godišnje izvozi više od 150 milijuna eura. Partneri Aluminija su poznate svjetske korporacije od kojih su najvažnije: Venture Coke Company LLC (Venco-Conoco joint Venture) iz Sjedinjenih Država, Glencore International AG iz Švicarske, Debis International trading GmbH, Daimler-Chrysler i VAW Aluminium Technologie GmbH iz Njemačke, Hydro ASA iz Norveške, Fiat iz Italije i TLM-ibenik iz Hrvatske. Aluminij samo za Mostar godišnje ostvari 40 milijuna eura prihoda.
U Mostaru se održava i bijenalni Međunarodni sajam gospodarstva Mostar (“Meunarodni sajam gospodarstva Mostar”), koji je započeo 1997. godine. Sajam je podijeljen u različite sekcije: “Sajam gospodarstva”, “Sajam vina”, “Sajam knjiga” i “Dan hrane.”