En raison de l'instabilité politique et des lacunes dans ses relations avec ses colonies, en particulier l'Indochine et l'Algérie, la Quatrième République française est tombée en 1958. Le peuple français a soutenu l'établissement d'une Cinquième République et le président français Charles de Gaulle l'a clairement fait savoir le 8 août 1958. , que les colonies françaises auraient à choisir entre une plus grande autonomie dans une nouvelle Communauté française ou une indépendance instantanée lors d'un vote le 28 septembre 1958. Les autres colonies ont choisi la première, mais la Guinée a voté de manière décisive pour l'indépendance, dirigée par Ahmed Sékou Touré, dont le parti démocrate Le Parti de Guinée (PDG) avait remporté 56 des 60 sièges aux élections territoriales de 1957. Les Français sont rapidement partis et la Guinée s'est déclarée une république souveraine et indépendante le 2 octobre 1958, avec Sékou Touré comme président.
La Guinée s'est rapidement alliée à l'Union soviétique après le départ de la France et a adopté la politique communiste. La Guinée, en revanche, penchait vers une forme chinoise de socialisme, et le partenariat fut de courte durée. Malgré cela, des nations capitalistes telles que les États-Unis ont continué à fournir une assistance et des investissements au pays. Même les relations avec la France se sont améliorées ; le commerce s'est développé après l'élection de Valéry Giscard d'Estaing à la présidence de la France et les deux nations ont échangé des visites officielles.
Touré a proclamé le PDG seul parti légitime en 1960. Le gouvernement et le PDG ont fusionné pendant les 24 années suivantes. Touré a été incontesté pendant quatre mandats de sept ans en tant que président, et les électeurs ont reçu une liste unique de candidats du PDG à l'Assemblée nationale tous les cinq ans. Touré est rapidement devenu un leader polarisant, prônant un socialisme africain hybride chez lui et un panafricanisme à l'étranger, et son administration est devenue intolérante à la critique, emprisonnant des centaines de personnes et étouffant la presse.
Au cours de cette période, le gouvernement guinéen a nationalisé le territoire, déposé les chefs nommés par les Français et les chefs traditionnels, et rompu les relations avec le gouvernement et les entreprises français. La situation économique de la Guinée est devenue aussi incertaine que sa position diplomatique, oscillant entre le soutien à l'Union soviétique et (à la fin des années 1970) le soutien aux États-Unis. Le gouvernement de Touré a attaqué des opposants réels et imaginaires, forçant des milliers d'opposants politiques à l'exil, alléguant des stratagèmes et des complots contre lui dans le pays et à l'étranger.
En 1970, les troupes d'opposition guinéennes expatriées ont aidé les soldats portugais de la Guinée portugaise voisine dans l' opération Green Sea , une incursion en Guinée. L'armée portugaise a cherché à assassiner ou à arrêter Sekou Touré pour son soutien au PAIGC, un groupe de guérilla opérant en Guinée portugaise, entre autres. Les troupes portugaises se sont retirées après avoir atteint la majorité de leurs objectifs après plusieurs jours de combats intenses. La fréquence des arrestations et des exécutions internes a augmenté sous le règne de Sékou Touré.
Un monument commémorant le triomphe militaire contre l'attaque portugaise en 1970. Le seul objectif que l'assaut portugais n'a pas atteint était la capture d'Ahmed Sékou Touré.
Sékou Touré est décédé le 26 mars 1984 aux États-Unis des suites d'une opération cardiaque et a été remplacé par le Premier ministre Louis Lansana Beavogui , qui devait servir de président par intérim jusqu'à la tenue de nouvelles élections.
Le 3 avril 1984, le PDG devait choisir un nouveau chef. Cet individu aurait été le seul candidat à la présidence en vertu de la constitution. Les colonels Lansana Conté et Diarra Traoré ont cependant pris le contrôle lors d'un coup d'État sans effusion de sang quelques heures seulement avant la conférence. Traoré a été Premier ministre jusqu'en décembre, date à laquelle Conté a pris la présidence.
Conté a rapidement condamné le bilan du régime précédent en matière de droits humains, a libéré 250 prisonniers politiques et a exhorté 200,000 2016 autres personnes à rentrer d'exil. Il a également précisé qu'il abandonnait le socialisme, bien que cela n'ait rien fait pour soulager la pauvreté, et la nation n'a montré aucun signe de progrès vers la démocratie.
Conté a déclaré une restauration au gouvernement civil en 1992, avec une élection présidentielle en 1993 et des élections législatives en 1995. (au cours desquelles son parti - le Parti de l'unité et du progrès - a remporté 71 des 114 sièges.) L'emprise de Conté sur le pouvoir est restée forte malgré son professait son attachement à la démocratie. Alpha Condé, le chef de l'opposition, a été emprisonné en septembre 2001 pour atteinte à la sécurité nationale, mais il a été libéré huit mois plus tard. Suite à cela, il s'exile en France.
Conté a planifié et remporté un référendum pour prolonger le mandat présidentiel en 2001, et il a commencé son troisième mandat en 2003 lorsque l'opposition a boycotté les élections. Conté a échappé à une tentative de meurtre présumée en janvier 2005 alors qu'il faisait une rare apparition publique à Conakry, la capitale guinéenne. Ses détracteurs le qualifiaient de « tyran fatigué » dont la disparition était inévitable, tandis que ses partisans pensaient qu'il gagnait la guerre contre les dissidents. La Guinée continue de faire face à des défis importants et, selon Foreign Policy, est sur le point de devenir un État défaillant.
Lorsque les insurgés ont traversé les frontières avec le Libéria et la Sierra Leone en 2000, la Guinée s'est retrouvée impliquée dans l'instabilité qui sévissait depuis longtemps dans le reste de l'Afrique de l'Ouest, et il a semblé pendant un certain temps que la nation était au bord de la guerre civile. Conté a affirmé que les dirigeants voisins enviaient les richesses naturelles de la Guinée, mais ces allégations ont été rejetées avec véhémence. La Guinée a conclu des accords avec ses voisins pour combattre les rebelles en 2003. Des protestations contre l'administration ont éclaté en 2007, aboutissant à la nomination d'un nouveau Premier ministre.