Aufgrund politischer Instabilität und Mängeln im Umgang mit seinen Kolonien, insbesondere Indochina und Algerien, fiel die Vierte Französische Republik 1958. Das französische Volk unterstützte die Gründung einer Fünften Republik, und der französische Präsident Charles de Gaulle machte dies am 8. August 1958 deutlich , dass Frankreichs Kolonien in einer Abstimmung am 28. September 1958 zwischen größerer Autonomie in einer neuen Französischen Gemeinschaft oder sofortiger Unabhängigkeit wählen müssten. Die anderen Kolonien wählten erstere, aber Guinea stimmte entschieden für die Unabhängigkeit, angeführt von Ahmed Sékou Touré, dessen Demokrat Die Partei von Guinea (PDG) hatte 56 bei territorialen Wahlen 60 von 1957 Sitzen gewonnen. Die Franzosen zogen bald ab, und Guinea erklärte sich am 2. Oktober 1958 zu einer souveränen und unabhängigen Republik mit Sékou Touré als Präsident.
Guinea verbündete sich nach dem Abzug Frankreichs schnell mit der Sowjetunion und übernahm die kommunistische Politik. Guinea hingegen neigte zu einer chinesischen Form des Sozialismus, und die Partnerschaft war nur von kurzer Dauer. Trotzdem leisteten kapitalistische Nationen wie die Vereinigten Staaten dem Land weiterhin Hilfe und Investitionen. Auch das Verhältnis zu Frankreich verbesserte sich; Der Handel wuchs nach der Wahl von Valéry Giscard d'Estaing zum französischen Präsidenten, und die beiden Nationen tauschten offizielle Besuche aus.
Touré erklärte 1960 die PDG zur einzig legitimen Partei. Regierung und PDG fusionierten für die folgenden 24 Jahre. Touré war unangefochten für vier siebenjährige Amtszeiten als Präsident, und die Wähler erhielten alle fünf Jahre eine einzige Liste von PDG-Kandidaten für die Nationalversammlung. Touré wurde bald zu einem polarisierenden Führer, der zu Hause einen hybriden afrikanischen Sozialismus und im Ausland einen Panafrikanismus befürwortete, und seine Regierung wurde Kritik gegenüber intolerant, inhaftierte Hunderte und erstickte die Presse.
Während dieser Zeit verstaatlichte die guineische Regierung Gebiete, setzte von Frankreich ernannte und traditionelle Führer ab und brach die Beziehungen zur französischen Regierung und zu Unternehmen ab. Die wirtschaftliche Situation Guineas wurde ebenso ungewiss wie seine diplomatische Haltung und schwankte zwischen der Unterstützung der Sowjetunion und (Ende der 1970er Jahre) der Unterstützung der Vereinigten Staaten. Tourés Regierung griff tatsächliche und imaginäre Gegner an, zwang Tausende von politischen Gegnern ins Exil und beschuldigte ihn im In- und Ausland mit Plänen und Verschwörungen.
1970 unterstützten ausgewanderte guineische Oppositionstruppen portugiesische Soldaten aus dem benachbarten portugiesischen Guinea bei der Operation Green Sea, einem Einfall in Guinea. Das portugiesische Militär versuchte, Sekou Toure unter anderem wegen seiner Unterstützung der PAIGC, einer Guerillagruppe, die in Portugiesisch-Guinea operiert, zu ermorden oder zu verhaften. Die portugiesischen Truppen zogen sich zurück, nachdem sie nach vielen Tagen intensiver Kämpfe die meisten ihrer Ziele erreicht hatten. Die Häufigkeit interner Verhaftungen und Hinrichtungen nahm während der Regierungszeit von Sékou Touré zu.
Ein Denkmal, das an den militärischen Triumph gegen den portugiesischen Angriff im Jahr 1970 erinnert. Das einzige Ziel, das der portugiesische Angriff nicht erreichte, war die Gefangennahme von Ahmed Sékou Touré.
Sékou Touré starb am 26. März 1984 in den Vereinigten Staaten nach einer Herzoperation und wurde von Premierminister Louis Lansana Beavogui abgelöst, der als vorläufiger Präsident fungieren sollte, bis Neuwahlen abgehalten werden konnten.
Am 3. April 1984 sollte die PDG einen neuen Führer wählen. Diese Person wäre laut Verfassung der einzige Anwärter auf das Amt des Präsidenten gewesen. Die Obersten Lansana Conté und Diarra Traoré übernahmen jedoch nur wenige Stunden vor der Konferenz in einem unblutigen Putsch die Kontrolle. Traoré war bis Dezember Premierminister, als Conté das Amt des Präsidenten übernahm.
Conté verurteilte schnell die Menschenrechtsbilanz des vorherigen Regimes, befreite 250 politische Gefangene und forderte weitere 200,000 Menschen auf, aus dem Exil zurückzukehren. Er machte auch deutlich, dass er den Sozialismus aufgab, obwohl dies nichts zur Linderung der Armut beitrug und die Nation keine Anzeichen von Fortschritten in Richtung Demokratie zeigte.
Conté erklärte 1992 die Wiederherstellung der Zivilregierung, mit Präsidentschaftswahlen 1993 und Parlamentswahlen 1995 (bei denen seine Partei – die Partei der Einheit und des Fortschritts – 71 von 114 Sitzen gewann). Contés Machtposition blieb trotz seiner stark bekennt sich zur Demokratie. Alpha Condé, der Oppositionsführer, wurde im September 2001 wegen Bedrohung der nationalen Sicherheit inhaftiert, aber acht Monate später wieder freigelassen. Anschließend ging er nach Frankreich ins Exil.
Conté plante und gewann ein Referendum zur Verlängerung der Amtszeit des Präsidenten im Jahr 2001, und er begann seine dritte Amtszeit im Jahr 2003, als die Opposition die Wahlen boykottierte. Conté entkam im Januar 2005 einem mutmaßlichen Mordversuch, als er in Conakry, der Hauptstadt Guineas, einen seltenen öffentlichen Auftritt hatte. Seine Kritiker nannten ihn einen „müden Tyrannen“, dessen Untergang unvermeidlich sei, während seine Unterstützer dachten, er würde den Krieg gegen Dissidenten gewinnen. Guinea steht weiterhin vor großen Herausforderungen und steht laut Außenpolitik kurz davor, ein gescheiterter Staat zu werden.
Als Aufständische im Jahr 2000 die Grenzen zu Liberia und Sierra Leone überquerten, wurde Guinea in die Instabilität verwickelt, die den Rest Westafrikas lange geplagt hatte, und es schien für eine Weile, als stünde das Land am Rande eines Bürgerkriegs. Conté behauptete, dass benachbarte Führer neidisch auf die natürlichen Reichtümer Guineas seien, aber diese Behauptungen wurden vehement zurückgewiesen. Guinea stimmte 2003 Vereinbarungen mit seinen Nachbarn zur Bekämpfung der Rebellen zu. 2007 brachen Proteste gegen die Regierung aus, die in der Ernennung eines neuen Premierministers gipfelten.