Пигмеите са първите, които се заселват в региона. Докато се движат, племената банту основно ги изместват и асимилират.
Първите европейци идват през 15 век. В Габон през 18-ти век възниква монархия, говореща миени, известна като Орунгу.
Бартоломю Робъртс, уелски пират, известен като Черен Барт, загива в морето край бреговете на нос Лопес на 10 февруари 1722 г. От 1719 до 1722 г. той атакува кораби по бреговете на Америка и Западна Африка.
През 1875 г. първата експедиция в района на Габон-Конго е проведена от френския авантюрист Пиер Саворгнан де Браза. Той създава Франсвил и впоследствие служи като колониален губернатор. Когато Франция официално завладява Габон през 1885 г., много племена банту живеят в региона, който днес е Габон.
Габон се присъединява към четирите региона на Френска Екваториална Африка през 1910 г., образувайки федерация, която просъществува до 1959 г. На 17 август 1960 г. тези региони получават независимост. Леон М'ба е първият президент на Габон, избран през 1961 г., заедно с Омар Бонго Ондимба като негов вицепрезидент.
След възхода на М'ба на власт пресата беше репресирана, политическите митинги бяха забранени, свободата на словото беше ограничена, други политически партии бяха постепенно изтласкани от власт, а Конституцията беше променена следвайки френските линии, за да предостави властта на президентството, което М'ба взе. Когато М'ба разпусна Народното събрание, за да установи еднопартийно управление през януари 1964 г., армейски преврат се опита да го свали и да възстанови парламентарната демокрация. В рамките на 24 часа пристигнаха френски парашутисти, за да възстановят властта на М'ба.
Въпреки масовите демонстрации и безредиците, превратът приключи след няколко дни битки и опозицията беше затворена. И до днес френските войски са разположени в Камп дьо Гол в покрайнините на града на Габон. Бонго пое президентския пост, когато М'Ба почина през 1967 г.
Бонго провъзгласява Габон за еднопартийна държава през март 1968 г., разпускайки БДГ и основавайки Демократична партия на Габона (PDG). Той приветства всички граждани на Габон да се присъединят, независимо от тяхната предишна политическа вярност. Бонго използва PDG като средство за удавяне на регионалните и племенни конфликти, които преди това разделиха политиката на Габон, за да създаде единно национално движение в полза на целите за развитие на правителството. През февруари 1975 г. Бонго е избран за президент; през април 1975 г. вицепрезидентството е премахнато и заменено с министър-председателство, което няма автоматично право на наследяване. Бонго е преизбран за 7-годишен мандат като президент през декември 1979 г. и ноември 1986 г.
Студенти и работници организираха насилствени протести и стачки в началото на 1990-те години, подхранвани от икономическо недоволство и желание за политически реформи. Bongo работеше със служителите по сектори в отговор на техните оплаквания, като направи значително намаление на заплащането. Той също така каза, че ще отвори PDG и ще проведе национална политическа конференция през март-април 1990 г., за да обсъди бъдещата политическа структура на Габон. На срещата присъстваха PDG и 74 политически групи. Управляващата PDG и нейните поддръжници бяха разделени на две свободни коалиции, Обединен фронт на опозиционните асоциации и партии, който включваше отцепилата се Morena Fundamental и Партията на прогреса на Габон.
Конференцията през април 1990 г. одобри значителни политически промени, включително създаването на национален Сенат, децентрализация на бюджетния процес, свобода на събранията и печата и премахване на необходимостта от виза за заминаване. Бонго подаде оставка като председател на PDG в опит да ръководи прехода на политическата система към многопартийна демокрация и беше сформирана преходна администрация, ръководена от новия министър-председател Казимир Ойе-Мба. Получената администрация, известна като Габонска социалдемократическа група (RSDG), беше по-малка от предишната и включваше членове на различни опозиционни групи в кабинета си. През май 1990 г. RSDG изготви временна конституция, която включва основен законопроект за правата и независима съдебна система, но дава на президента широки административни правомощия. Този документ влезе в сила през март 1991 г. след допълнително разглеждане от конституционна комисия и Народното събрание.
Въпреки това, опозицията срещу PDG продължава след срещата през април 1990 г. и два опита за преврат бяха открити и осуетени през септември 1990 г. Въпреки антиправителствените протести след неочакваната смърт на опозиционен лидер, PDG спечели силно мнозинство в първата многопартийна национална Избори за парламент след почти 30 години през септември – октомври 1990 г.
След преизбирането на президента Омар Бонго с 51% от гласовете през декември 1993 г., опозиционните кандидати отказаха да приемат резултатите. След сериозни граждански вълнения правителството и опозиционните групи се съгласиха да работят за политическо решение. Тези дискусии доведоха до Парижките споразумения, които бяха подписани през ноември 1994 г. и включваха много опозиционни лидери в правителство на националното единство. Това споразумение обаче бързо се разпадна и парламентарните и общинските избори през 1996 и 1997 г. поставиха началото на връщане към партизанската политика. PDG постигна категорична победа на парламентарните избори, но опозиционните кметове бяха избрани в много големи градове, включително Либревил, на общинските избори през 1997 г.
През декември 1998 г. президентът Омар Бонго стигна до преизбирането с огромно мнозинство от гласовете, въпреки раздвоената опозиция. Въпреки многобройните предполагаеми аномалии, няколко чуждестранни наблюдатели определиха резултатите като представителни и нямаше никакви насилствени вълнения, предшестващи изборите през 1993 г. PDG и асоциираните независими лица контролираха Народното събрание почти изцяло след мирни, но неправилни парламентарни избори през 2001–2002 г., които бяха бойкотирани от редица незначителни опозиционни партии и строго осъдени за административни пропуски. Президентът Омар Бонго беше преизбран през ноември 2005 г. за шести мандат. Той беше удобно преизбран, въпреки че опонентите твърдят, че изборите са били засегнати от нередности. След обявяването на победата му имаше няколко инцидента на насилие, но Габон остана спокоен като цяло.
През декември 2006 г. бяха проведени нови избори за Народно събрание. Конституционният съд отмени много места, които бяха оспорени поради нередности в гласуването, но PDG запази контрола над Народното събрание на балотажа на изборите в началото на 2007 г.
Президентът Омар Бонго почина от сърдечен арест на 8 юни 2009 г. в испанска болница в Барселона, което сигнализира за началото на нова ера в политиката на Габон. Роуз Франсин Рогомбе, председател на Сената, беше назначена за временен президент на 10 юни 2009 г. в съответствие с ревизираната конституция. На 30 август 2009 г. бяха проведени първите конкурентни избори в историята на Габон без Омар Бонго като кандидат, с 18 кандидати за президент. Имаше няколко дребни демонстрации преди изборите, но без големи смущения. След триседмичен преглед от Конституционния съд, синът на Омар Бонго, ръководителят на управляващата партия Али Бонго Ондимба, беше официално обявен за победител; встъпването му в длъжност се състоя на 16 октомври 2009 г.
Много опозиционни кандидати твърдяха за изборни измами и първото публикуване на резултатите от изборите предизвика необичайно насилствени демонстрации в Порт-Жентил, вторият по големина град в страната и дългогодишна крепост на съпротива срещу администрацията на PDG. Жителите на Порт-Жентил се втурнаха по улиците, като подпалиха редица фирми и домове, включително френското консулство и местния затвор. Само четирима души бяха убити при безредиците, според официални данни, но опозицията и местните лидери твърдят, че има много повече. За да помогнат на борещата се полиция, жандармеристите и военните бяха изпратени в Порт-Жентил и беше наложен полицейски час за повече от три месеца.
През юни 2010 г. бяха проведени частични законодателни частични избори. За първи път участие взе новосформирана коалиция от партии - Националният съюз (ООН). Дезертьори от PDG, които напуснаха партията след смъртта на Омар Бонго, съставляват мнозинството в ООН. PDG спечели три от петте места в ожесточена борба, докато ООН спечели две; и двете страни обявиха победа.